Protein–RNA interactions for Protein: O15379

HDAC3, Histone deacetylase 3, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC3O15379 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
HDAC3O15379 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
HDAC3O15379 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
HDAC3O15379 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
HDAC3O15379 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
HDAC3O15379 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
HDAC3O15379 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
HDAC3O15379 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
HDAC3O15379 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
HDAC3O15379 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
HDAC3O15379 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
HDAC3O15379 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
HDAC3O15379 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
HDAC3O15379 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
HDAC3O15379 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
HDAC3O15379 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
HDAC3O15379 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
HDAC3O15379 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
HDAC3O15379 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HDAC3O15379 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HDAC3O15379 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HDAC3O15379 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HDAC3O15379 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HDAC3O15379 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HDAC3O15379 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HDAC3O15379 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HDAC3O15379 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HDAC3O15379 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HDAC3O15379 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HDAC3O15379 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HDAC3O15379 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HDAC3O15379 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HDAC3O15379 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HDAC3O15379 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HDAC3O15379 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
HDAC3O15379 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
HDAC3O15379 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HDAC3O15379 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HDAC3O15379 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HDAC3O15379 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
HDAC3O15379 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HDAC3O15379 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HDAC3O15379 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HDAC3O15379 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HDAC3O15379 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HDAC3O15379 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HDAC3O15379 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HDAC3O15379 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HDAC3O15379 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HDAC3O15379 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HDAC3O15379 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HDAC3O15379 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HDAC3O15379 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HDAC3O15379 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HDAC3O15379 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HDAC3O15379 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HDAC3O15379 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HDAC3O15379 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HDAC3O15379 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HDAC3O15379 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HDAC3O15379 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HDAC3O15379 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HDAC3O15379 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HDAC3O15379 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HDAC3O15379 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HDAC3O15379 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HDAC3O15379 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HDAC3O15379 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HDAC3O15379 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HDAC3O15379 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HDAC3O15379 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
HDAC3O15379 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HDAC3O15379 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HDAC3O15379 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
HDAC3O15379 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HDAC3O15379 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HDAC3O15379 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HDAC3O15379 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HDAC3O15379 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HDAC3O15379 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HDAC3O15379 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HDAC3O15379 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HDAC3O15379 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HDAC3O15379 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HDAC3O15379 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HDAC3O15379 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HDAC3O15379 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HDAC3O15379 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HDAC3O15379 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HDAC3O15379 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HDAC3O15379 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HDAC3O15379 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HDAC3O15379 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HDAC3O15379 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HDAC3O15379 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HDAC3O15379 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HDAC3O15379 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HDAC3O15379 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HDAC3O15379 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HDAC3O15379 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms