Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIL8

PHF11, PHD finger protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF11Q9UIL8 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PHF11Q9UIL8 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PHF11Q9UIL8 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PHF11Q9UIL8 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PHF11Q9UIL8 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PHF11Q9UIL8 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PHF11Q9UIL8 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PHF11Q9UIL8 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PHF11Q9UIL8 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PHF11Q9UIL8 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PHF11Q9UIL8 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PHF11Q9UIL8 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PHF11Q9UIL8 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PHF11Q9UIL8 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PHF11Q9UIL8 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PHF11Q9UIL8 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PHF11Q9UIL8 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PHF11Q9UIL8 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PHF11Q9UIL8 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PHF11Q9UIL8 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PHF11Q9UIL8 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PHF11Q9UIL8 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PHF11Q9UIL8 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PHF11Q9UIL8 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PHF11Q9UIL8 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PHF11Q9UIL8 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PHF11Q9UIL8 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PHF11Q9UIL8 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PHF11Q9UIL8 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PHF11Q9UIL8 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
PHF11Q9UIL8 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PHF11Q9UIL8 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
PHF11Q9UIL8 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PHF11Q9UIL8 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PHF11Q9UIL8 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PHF11Q9UIL8 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PHF11Q9UIL8 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
PHF11Q9UIL8 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PHF11Q9UIL8 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PHF11Q9UIL8 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PHF11Q9UIL8 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PHF11Q9UIL8 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PHF11Q9UIL8 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
PHF11Q9UIL8 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PHF11Q9UIL8 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PHF11Q9UIL8 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PHF11Q9UIL8 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PHF11Q9UIL8 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
PHF11Q9UIL8 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
PHF11Q9UIL8 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PHF11Q9UIL8 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PHF11Q9UIL8 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PHF11Q9UIL8 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PHF11Q9UIL8 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PHF11Q9UIL8 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PHF11Q9UIL8 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PHF11Q9UIL8 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
PHF11Q9UIL8 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PHF11Q9UIL8 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PHF11Q9UIL8 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PHF11Q9UIL8 ELFN2-207ENST00000613079 8360 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PHF11Q9UIL8 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PHF11Q9UIL8 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PHF11Q9UIL8 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PHF11Q9UIL8 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PHF11Q9UIL8 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PHF11Q9UIL8 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PHF11Q9UIL8 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PHF11Q9UIL8 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PHF11Q9UIL8 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PHF11Q9UIL8 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PHF11Q9UIL8 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PHF11Q9UIL8 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PHF11Q9UIL8 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PHF11Q9UIL8 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PHF11Q9UIL8 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PHF11Q9UIL8 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PHF11Q9UIL8 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PHF11Q9UIL8 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PHF11Q9UIL8 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PHF11Q9UIL8 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PHF11Q9UIL8 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PHF11Q9UIL8 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PHF11Q9UIL8 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PHF11Q9UIL8 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PHF11Q9UIL8 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PHF11Q9UIL8 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
PHF11Q9UIL8 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PHF11Q9UIL8 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PHF11Q9UIL8 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PHF11Q9UIL8 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PHF11Q9UIL8 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PHF11Q9UIL8 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
PHF11Q9UIL8 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PHF11Q9UIL8 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PHF11Q9UIL8 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
PHF11Q9UIL8 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
PHF11Q9UIL8 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PHF11Q9UIL8 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PHF11Q9UIL8 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.5 ms