Protein–RNA interactions for Protein: Q9P003

CNIH4, Protein cornichon homolog 4, humanhuman

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Length 139 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNIH4Q9P003 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CNIH4Q9P003 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CNIH4Q9P003 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CNIH4Q9P003 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CNIH4Q9P003 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CNIH4Q9P003 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CNIH4Q9P003 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CNIH4Q9P003 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CNIH4Q9P003 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CNIH4Q9P003 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CNIH4Q9P003 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CNIH4Q9P003 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CNIH4Q9P003 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CNIH4Q9P003 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CNIH4Q9P003 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CNIH4Q9P003 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CNIH4Q9P003 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CNIH4Q9P003 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CNIH4Q9P003 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CNIH4Q9P003 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CNIH4Q9P003 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CNIH4Q9P003 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CNIH4Q9P003 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CNIH4Q9P003 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CNIH4Q9P003 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CNIH4Q9P003 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CNIH4Q9P003 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CNIH4Q9P003 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CNIH4Q9P003 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CNIH4Q9P003 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CNIH4Q9P003 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CNIH4Q9P003 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CNIH4Q9P003 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CNIH4Q9P003 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CNIH4Q9P003 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CNIH4Q9P003 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CNIH4Q9P003 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CNIH4Q9P003 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CNIH4Q9P003 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CNIH4Q9P003 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CNIH4Q9P003 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CNIH4Q9P003 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CNIH4Q9P003 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CNIH4Q9P003 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CNIH4Q9P003 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CNIH4Q9P003 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CNIH4Q9P003 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CNIH4Q9P003 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CNIH4Q9P003 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CNIH4Q9P003 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CNIH4Q9P003 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CNIH4Q9P003 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CNIH4Q9P003 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CNIH4Q9P003 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CNIH4Q9P003 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CNIH4Q9P003 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CNIH4Q9P003 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CNIH4Q9P003 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CNIH4Q9P003 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CNIH4Q9P003 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CNIH4Q9P003 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CNIH4Q9P003 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CNIH4Q9P003 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CNIH4Q9P003 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CNIH4Q9P003 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CNIH4Q9P003 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CNIH4Q9P003 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CNIH4Q9P003 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
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CNIH4Q9P003 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CNIH4Q9P003 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
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CNIH4Q9P003 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CNIH4Q9P003 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CNIH4Q9P003 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CNIH4Q9P003 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CNIH4Q9P003 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CNIH4Q9P003 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CNIH4Q9P003 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CNIH4Q9P003 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CNIH4Q9P003 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CNIH4Q9P003 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CNIH4Q9P003 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CNIH4Q9P003 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CNIH4Q9P003 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CNIH4Q9P003 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CNIH4Q9P003 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CNIH4Q9P003 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CNIH4Q9P003 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CNIH4Q9P003 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CNIH4Q9P003 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CNIH4Q9P003 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CNIH4Q9P003 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CNIH4Q9P003 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CNIH4Q9P003 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CNIH4Q9P003 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CNIH4Q9P003 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
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