Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6B4

CLMP, CXADR-like membrane protein, humanhuman

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLMPQ9H6B4 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CLMPQ9H6B4 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLMPQ9H6B4 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLMPQ9H6B4 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLMPQ9H6B4 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLMPQ9H6B4 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLMPQ9H6B4 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLMPQ9H6B4 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLMPQ9H6B4 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLMPQ9H6B4 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLMPQ9H6B4 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLMPQ9H6B4 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLMPQ9H6B4 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLMPQ9H6B4 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLMPQ9H6B4 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLMPQ9H6B4 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLMPQ9H6B4 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CLMPQ9H6B4 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLMPQ9H6B4 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLMPQ9H6B4 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLMPQ9H6B4 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLMPQ9H6B4 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLMPQ9H6B4 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLMPQ9H6B4 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLMPQ9H6B4 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLMPQ9H6B4 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLMPQ9H6B4 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLMPQ9H6B4 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLMPQ9H6B4 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CLMPQ9H6B4 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLMPQ9H6B4 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLMPQ9H6B4 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLMPQ9H6B4 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLMPQ9H6B4 ATP5J-205ENST00000400094 589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLMPQ9H6B4 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CLMPQ9H6B4 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLMPQ9H6B4 PARP8-206ENST00000503665 572 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLMPQ9H6B4 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLMPQ9H6B4 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CLMPQ9H6B4 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLMPQ9H6B4 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLMPQ9H6B4 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLMPQ9H6B4 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLMPQ9H6B4 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLMPQ9H6B4 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLMPQ9H6B4 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLMPQ9H6B4 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLMPQ9H6B4 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLMPQ9H6B4 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLMPQ9H6B4 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLMPQ9H6B4 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLMPQ9H6B4 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLMPQ9H6B4 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLMPQ9H6B4 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLMPQ9H6B4 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLMPQ9H6B4 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLMPQ9H6B4 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLMPQ9H6B4 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLMPQ9H6B4 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLMPQ9H6B4 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLMPQ9H6B4 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLMPQ9H6B4 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLMPQ9H6B4 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLMPQ9H6B4 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLMPQ9H6B4 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLMPQ9H6B4 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CLMPQ9H6B4 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLMPQ9H6B4 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLMPQ9H6B4 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLMPQ9H6B4 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CLMPQ9H6B4 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLMPQ9H6B4 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLMPQ9H6B4 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLMPQ9H6B4 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLMPQ9H6B4 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLMPQ9H6B4 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CLMPQ9H6B4 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLMPQ9H6B4 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLMPQ9H6B4 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLMPQ9H6B4 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLMPQ9H6B4 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLMPQ9H6B4 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLMPQ9H6B4 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLMPQ9H6B4 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLMPQ9H6B4 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLMPQ9H6B4 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLMPQ9H6B4 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLMPQ9H6B4 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CLMPQ9H6B4 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CLMPQ9H6B4 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CLMPQ9H6B4 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CLMPQ9H6B4 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CLMPQ9H6B4 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CLMPQ9H6B4 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CLMPQ9H6B4 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CLMPQ9H6B4 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CLMPQ9H6B4 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CLMPQ9H6B4 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CLMPQ9H6B4 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CLMPQ9H6B4 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 1063.1 ms