Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQK8

LPIN3, Phosphatidate phosphatase LPIN3, humanhuman

Predictions only

Length 851 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LPIN3Q9BQK8 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LPIN3Q9BQK8 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LPIN3Q9BQK8 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
LPIN3Q9BQK8 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LPIN3Q9BQK8 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
LPIN3Q9BQK8 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
LPIN3Q9BQK8 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
LPIN3Q9BQK8 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LPIN3Q9BQK8 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
LPIN3Q9BQK8 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
LPIN3Q9BQK8 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
LPIN3Q9BQK8 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LPIN3Q9BQK8 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LPIN3Q9BQK8 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
LPIN3Q9BQK8 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LPIN3Q9BQK8 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LPIN3Q9BQK8 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
LPIN3Q9BQK8 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LPIN3Q9BQK8 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LPIN3Q9BQK8 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
LPIN3Q9BQK8 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
LPIN3Q9BQK8 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
LPIN3Q9BQK8 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
LPIN3Q9BQK8 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
LPIN3Q9BQK8 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LPIN3Q9BQK8 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LPIN3Q9BQK8 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LPIN3Q9BQK8 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LPIN3Q9BQK8 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
LPIN3Q9BQK8 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
LPIN3Q9BQK8 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
LPIN3Q9BQK8 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LPIN3Q9BQK8 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
LPIN3Q9BQK8 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
LPIN3Q9BQK8 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
LPIN3Q9BQK8 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LPIN3Q9BQK8 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LPIN3Q9BQK8 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
LPIN3Q9BQK8 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LPIN3Q9BQK8 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
LPIN3Q9BQK8 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LPIN3Q9BQK8 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
LPIN3Q9BQK8 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
LPIN3Q9BQK8 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LPIN3Q9BQK8 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LPIN3Q9BQK8 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
LPIN3Q9BQK8 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
LPIN3Q9BQK8 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
LPIN3Q9BQK8 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LPIN3Q9BQK8 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
LPIN3Q9BQK8 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
LPIN3Q9BQK8 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
LPIN3Q9BQK8 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
LPIN3Q9BQK8 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
LPIN3Q9BQK8 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
LPIN3Q9BQK8 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
LPIN3Q9BQK8 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
LPIN3Q9BQK8 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
LPIN3Q9BQK8 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
LPIN3Q9BQK8 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
LPIN3Q9BQK8 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
LPIN3Q9BQK8 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
LPIN3Q9BQK8 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
LPIN3Q9BQK8 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
LPIN3Q9BQK8 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
LPIN3Q9BQK8 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
LPIN3Q9BQK8 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
LPIN3Q9BQK8 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
LPIN3Q9BQK8 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
LPIN3Q9BQK8 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
LPIN3Q9BQK8 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
LPIN3Q9BQK8 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
LPIN3Q9BQK8 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
LPIN3Q9BQK8 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
LPIN3Q9BQK8 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
LPIN3Q9BQK8 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
LPIN3Q9BQK8 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
LPIN3Q9BQK8 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
LPIN3Q9BQK8 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
LPIN3Q9BQK8 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
LPIN3Q9BQK8 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
LPIN3Q9BQK8 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
LPIN3Q9BQK8 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
LPIN3Q9BQK8 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
LPIN3Q9BQK8 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
LPIN3Q9BQK8 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
LPIN3Q9BQK8 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
LPIN3Q9BQK8 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
LPIN3Q9BQK8 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
LPIN3Q9BQK8 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
LPIN3Q9BQK8 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
LPIN3Q9BQK8 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
LPIN3Q9BQK8 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
LPIN3Q9BQK8 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
LPIN3Q9BQK8 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
LPIN3Q9BQK8 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
LPIN3Q9BQK8 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
LPIN3Q9BQK8 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
LPIN3Q9BQK8 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
LPIN3Q9BQK8 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms