Protein–RNA interactions for Protein: Q96L92

SNX27, Sorting nexin-27, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX27Q96L92 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SNX27Q96L92 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SNX27Q96L92 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SNX27Q96L92 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SNX27Q96L92 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SNX27Q96L92 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SNX27Q96L92 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SNX27Q96L92 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SNX27Q96L92 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SNX27Q96L92 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SNX27Q96L92 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SNX27Q96L92 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SNX27Q96L92 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SNX27Q96L92 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SNX27Q96L92 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SNX27Q96L92 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SNX27Q96L92 LINC01205-202ENST00000497996 1493 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SNX27Q96L92 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SNX27Q96L92 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SNX27Q96L92 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SNX27Q96L92 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SNX27Q96L92 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SNX27Q96L92 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
SNX27Q96L92 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SNX27Q96L92 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SNX27Q96L92 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SNX27Q96L92 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SNX27Q96L92 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
SNX27Q96L92 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SNX27Q96L92 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SNX27Q96L92 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SNX27Q96L92 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SNX27Q96L92 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SNX27Q96L92 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SNX27Q96L92 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SNX27Q96L92 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SNX27Q96L92 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SNX27Q96L92 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SNX27Q96L92 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SNX27Q96L92 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SNX27Q96L92 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SNX27Q96L92 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SNX27Q96L92 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
SNX27Q96L92 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SNX27Q96L92 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SNX27Q96L92 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SNX27Q96L92 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SNX27Q96L92 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SNX27Q96L92 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SNX27Q96L92 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
SNX27Q96L92 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SNX27Q96L92 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SNX27Q96L92 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SNX27Q96L92 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SNX27Q96L92 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SNX27Q96L92 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SNX27Q96L92 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SNX27Q96L92 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SNX27Q96L92 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SNX27Q96L92 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SNX27Q96L92 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SNX27Q96L92 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SNX27Q96L92 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SNX27Q96L92 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SNX27Q96L92 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SNX27Q96L92 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SNX27Q96L92 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SNX27Q96L92 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
SNX27Q96L92 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SNX27Q96L92 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SNX27Q96L92 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SNX27Q96L92 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SNX27Q96L92 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SNX27Q96L92 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SNX27Q96L92 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SNX27Q96L92 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SNX27Q96L92 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SNX27Q96L92 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SNX27Q96L92 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SNX27Q96L92 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SNX27Q96L92 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SNX27Q96L92 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SNX27Q96L92 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SNX27Q96L92 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SNX27Q96L92 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SNX27Q96L92 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SNX27Q96L92 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SNX27Q96L92 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SNX27Q96L92 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SNX27Q96L92 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SNX27Q96L92 RPF1-202ENST00000370656 724 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SNX27Q96L92 PFDN6-204ENST00000395131 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SNX27Q96L92 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SNX27Q96L92 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SNX27Q96L92 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
SNX27Q96L92 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SNX27Q96L92 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SNX27Q96L92 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
SNX27Q96L92 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SNX27Q96L92 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.8 ms