Protein–RNA interactions for Protein: Q96B86

RGMA, Repulsive guidance molecule A, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGMAQ96B86 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RGMAQ96B86 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RGMAQ96B86 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RGMAQ96B86 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RGMAQ96B86 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RGMAQ96B86 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RGMAQ96B86 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RGMAQ96B86 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RGMAQ96B86 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RGMAQ96B86 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RGMAQ96B86 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RGMAQ96B86 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
RGMAQ96B86 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RGMAQ96B86 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RGMAQ96B86 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RGMAQ96B86 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RGMAQ96B86 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RGMAQ96B86 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RGMAQ96B86 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RGMAQ96B86 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
RGMAQ96B86 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RGMAQ96B86 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RGMAQ96B86 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RGMAQ96B86 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RGMAQ96B86 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RGMAQ96B86 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RGMAQ96B86 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RGMAQ96B86 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RGMAQ96B86 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RGMAQ96B86 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RGMAQ96B86 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
RGMAQ96B86 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
RGMAQ96B86 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
RGMAQ96B86 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RGMAQ96B86 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
RGMAQ96B86 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RGMAQ96B86 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RGMAQ96B86 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RGMAQ96B86 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
RGMAQ96B86 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RGMAQ96B86 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RGMAQ96B86 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RGMAQ96B86 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RGMAQ96B86 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RGMAQ96B86 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RGMAQ96B86 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RGMAQ96B86 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RGMAQ96B86 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RGMAQ96B86 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RGMAQ96B86 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RGMAQ96B86 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RGMAQ96B86 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RGMAQ96B86 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RGMAQ96B86 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RGMAQ96B86 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RGMAQ96B86 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RGMAQ96B86 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RGMAQ96B86 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RGMAQ96B86 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RGMAQ96B86 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RGMAQ96B86 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RGMAQ96B86 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RGMAQ96B86 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RGMAQ96B86 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RGMAQ96B86 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RGMAQ96B86 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
RGMAQ96B86 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RGMAQ96B86 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RGMAQ96B86 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RGMAQ96B86 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RGMAQ96B86 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RGMAQ96B86 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RGMAQ96B86 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RGMAQ96B86 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RGMAQ96B86 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RGMAQ96B86 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RGMAQ96B86 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RGMAQ96B86 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RGMAQ96B86 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RGMAQ96B86 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RGMAQ96B86 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RGMAQ96B86 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RGMAQ96B86 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RGMAQ96B86 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RGMAQ96B86 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RGMAQ96B86 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RGMAQ96B86 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RGMAQ96B86 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RGMAQ96B86 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RGMAQ96B86 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RGMAQ96B86 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RGMAQ96B86 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RGMAQ96B86 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RGMAQ96B86 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RGMAQ96B86 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RGMAQ96B86 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RGMAQ96B86 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RGMAQ96B86 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RGMAQ96B86 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RGMAQ96B86 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.9 ms