Protein–RNA interactions for Protein: Q8N159

NAGS, N-acetylglutamate synthase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 534 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NAGSQ8N159 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
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NAGSQ8N159 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NAGSQ8N159 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NAGSQ8N159 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NAGSQ8N159 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
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NAGSQ8N159 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
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NAGSQ8N159 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NAGSQ8N159 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NAGSQ8N159 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
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NAGSQ8N159 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NAGSQ8N159 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
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NAGSQ8N159 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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NAGSQ8N159 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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NAGSQ8N159 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NAGSQ8N159 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NAGSQ8N159 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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NAGSQ8N159 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
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NAGSQ8N159 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NAGSQ8N159 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NAGSQ8N159 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NAGSQ8N159 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NAGSQ8N159 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
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NAGSQ8N159 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
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NAGSQ8N159 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
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NAGSQ8N159 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
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NAGSQ8N159 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
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NAGSQ8N159 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
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NAGSQ8N159 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NAGSQ8N159 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NAGSQ8N159 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NAGSQ8N159 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NAGSQ8N159 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NAGSQ8N159 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NAGSQ8N159 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NAGSQ8N159 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NAGSQ8N159 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NAGSQ8N159 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NAGSQ8N159 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NAGSQ8N159 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NAGSQ8N159 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NAGSQ8N159 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
NAGSQ8N159 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
NAGSQ8N159 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NAGSQ8N159 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NAGSQ8N159 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NAGSQ8N159 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NAGSQ8N159 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NAGSQ8N159 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NAGSQ8N159 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NAGSQ8N159 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
NAGSQ8N159 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NAGSQ8N159 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
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