Protein–RNA interactions for Protein: Q7L804

RAB11FIP2, Rab11 family-interacting protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 512 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB11FIP2Q7L804 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB11FIP2Q7L804 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB11FIP2Q7L804 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB11FIP2Q7L804 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB11FIP2Q7L804 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB11FIP2Q7L804 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB11FIP2Q7L804 AL645941.1-201ENST00000415875 338 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB11FIP2Q7L804 RPS2P32-201ENST00000439199 892 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB11FIP2Q7L804 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB11FIP2Q7L804 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB11FIP2Q7L804 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB11FIP2Q7L804 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB11FIP2Q7L804 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB11FIP2Q7L804 ATF7-204ENST00000548118 774 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB11FIP2Q7L804 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB11FIP2Q7L804 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB11FIP2Q7L804 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB11FIP2Q7L804 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB11FIP2Q7L804 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB11FIP2Q7L804 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB11FIP2Q7L804 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB11FIP2Q7L804 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB11FIP2Q7L804 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB11FIP2Q7L804 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB11FIP2Q7L804 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB11FIP2Q7L804 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB11FIP2Q7L804 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB11FIP2Q7L804 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB11FIP2Q7L804 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB11FIP2Q7L804 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB11FIP2Q7L804 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB11FIP2Q7L804 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB11FIP2Q7L804 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB11FIP2Q7L804 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB11FIP2Q7L804 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB11FIP2Q7L804 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB11FIP2Q7L804 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB11FIP2Q7L804 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB11FIP2Q7L804 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB11FIP2Q7L804 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB11FIP2Q7L804 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB11FIP2Q7L804 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB11FIP2Q7L804 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB11FIP2Q7L804 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB11FIP2Q7L804 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB11FIP2Q7L804 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB11FIP2Q7L804 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB11FIP2Q7L804 MIR658-201ENST00000385210 100 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB11FIP2Q7L804 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB11FIP2Q7L804 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB11FIP2Q7L804 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB11FIP2Q7L804 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB11FIP2Q7L804 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB11FIP2Q7L804 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB11FIP2Q7L804 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB11FIP2Q7L804 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB11FIP2Q7L804 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB11FIP2Q7L804 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB11FIP2Q7L804 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB11FIP2Q7L804 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB11FIP2Q7L804 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB11FIP2Q7L804 AC021054.1-202ENST00000543884 599 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB11FIP2Q7L804 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB11FIP2Q7L804 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB11FIP2Q7L804 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB11FIP2Q7L804 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB11FIP2Q7L804 MIR6799-201ENST00000620297 69 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB11FIP2Q7L804 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB11FIP2Q7L804 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB11FIP2Q7L804 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB11FIP2Q7L804 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB11FIP2Q7L804 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB11FIP2Q7L804 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB11FIP2Q7L804 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB11FIP2Q7L804 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB11FIP2Q7L804 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB11FIP2Q7L804 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB11FIP2Q7L804 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB11FIP2Q7L804 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB11FIP2Q7L804 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB11FIP2Q7L804 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB11FIP2Q7L804 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB11FIP2Q7L804 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB11FIP2Q7L804 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB11FIP2Q7L804 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB11FIP2Q7L804 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB11FIP2Q7L804 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB11FIP2Q7L804 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB11FIP2Q7L804 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB11FIP2Q7L804 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB11FIP2Q7L804 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB11FIP2Q7L804 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB11FIP2Q7L804 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB11FIP2Q7L804 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB11FIP2Q7L804 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB11FIP2Q7L804 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB11FIP2Q7L804 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB11FIP2Q7L804 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB11FIP2Q7L804 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB11FIP2Q7L804 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.1 ms