Protein–RNA interactions for Protein: Q70EL4

USP43, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 43, humanhuman

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Length 1,123 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP43Q70EL4 MYH6-201ENST00000356287 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
USP43Q70EL4 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
USP43Q70EL4 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
USP43Q70EL4 CARHSP1-220ENST00000619881 2849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
USP43Q70EL4 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
USP43Q70EL4 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
USP43Q70EL4 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC14.83□□□□□ -0.03
USP43Q70EL4 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
USP43Q70EL4 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC14.83□□□□□ -0.03
USP43Q70EL4 CCHCR1-201ENST00000376266 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
USP43Q70EL4 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
USP43Q70EL4 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
USP43Q70EL4 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
USP43Q70EL4 USP31-203ENST00000567975 2142 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
USP43Q70EL4 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
USP43Q70EL4 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
USP43Q70EL4 PARD3B-204ENST00000406610 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
USP43Q70EL4 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
USP43Q70EL4 OR2I1P-209ENST00000641730 5365 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
USP43Q70EL4 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
USP43Q70EL4 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
USP43Q70EL4 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
USP43Q70EL4 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
USP43Q70EL4 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
USP43Q70EL4 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
USP43Q70EL4 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
USP43Q70EL4 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
USP43Q70EL4 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
USP43Q70EL4 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
USP43Q70EL4 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
USP43Q70EL4 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
USP43Q70EL4 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
USP43Q70EL4 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
USP43Q70EL4 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
USP43Q70EL4 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
USP43Q70EL4 GOPC-203ENST00000535237 4460 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
USP43Q70EL4 ARPP19-202ENST00000561650 3245 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
USP43Q70EL4 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
USP43Q70EL4 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
USP43Q70EL4 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
USP43Q70EL4 UBTF-201ENST00000302904 4997 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
USP43Q70EL4 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
USP43Q70EL4 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
USP43Q70EL4 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
USP43Q70EL4 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
USP43Q70EL4 AC004706.4-201ENST00000634965 3537 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
USP43Q70EL4 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
USP43Q70EL4 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
USP43Q70EL4 UBAP1-202ENST00000359544 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
USP43Q70EL4 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
USP43Q70EL4 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
USP43Q70EL4 GLUL-202ENST00000331872 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
USP43Q70EL4 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
USP43Q70EL4 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
USP43Q70EL4 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
USP43Q70EL4 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
USP43Q70EL4 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
USP43Q70EL4 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
USP43Q70EL4 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
USP43Q70EL4 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
USP43Q70EL4 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
USP43Q70EL4 VPS9D1-201ENST00000389386 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
USP43Q70EL4 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
USP43Q70EL4 CUL7-203ENST00000535468 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
USP43Q70EL4 AC010247.2-201ENST00000559786 1955 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
USP43Q70EL4 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
USP43Q70EL4 MAP3K12-205ENST00000547488 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
USP43Q70EL4 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
USP43Q70EL4 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
USP43Q70EL4 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
USP43Q70EL4 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
USP43Q70EL4 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
USP43Q70EL4 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
USP43Q70EL4 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
USP43Q70EL4 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
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USP43Q70EL4 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
USP43Q70EL4 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
USP43Q70EL4 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
USP43Q70EL4 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
USP43Q70EL4 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
USP43Q70EL4 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC14.82□□□□□ -0.04
USP43Q70EL4 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
USP43Q70EL4 JPH4-201ENST00000356300 4278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
USP43Q70EL4 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
USP43Q70EL4 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
USP43Q70EL4 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
USP43Q70EL4 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
USP43Q70EL4 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
USP43Q70EL4 HSD17B4-206ENST00000504811 2740 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
USP43Q70EL4 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
USP43Q70EL4 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
USP43Q70EL4 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
USP43Q70EL4 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
USP43Q70EL4 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
USP43Q70EL4 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
USP43Q70EL4 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
USP43Q70EL4 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
USP43Q70EL4 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
USP43Q70EL4 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
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