Protein–RNA interactions for Protein: Q6Y1H2

HACD2, Very-long-chain (3R)-3-hydroxyacyl-CoA dehydratase 2, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HACD2Q6Y1H2 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HACD2Q6Y1H2 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HACD2Q6Y1H2 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HACD2Q6Y1H2 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HACD2Q6Y1H2 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HACD2Q6Y1H2 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HACD2Q6Y1H2 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HACD2Q6Y1H2 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
HACD2Q6Y1H2 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HACD2Q6Y1H2 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HACD2Q6Y1H2 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HACD2Q6Y1H2 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HACD2Q6Y1H2 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HACD2Q6Y1H2 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HACD2Q6Y1H2 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HACD2Q6Y1H2 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HACD2Q6Y1H2 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HACD2Q6Y1H2 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HACD2Q6Y1H2 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HACD2Q6Y1H2 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HACD2Q6Y1H2 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
HACD2Q6Y1H2 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HACD2Q6Y1H2 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
HACD2Q6Y1H2 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HACD2Q6Y1H2 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HACD2Q6Y1H2 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HACD2Q6Y1H2 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HACD2Q6Y1H2 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HACD2Q6Y1H2 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HACD2Q6Y1H2 AC023908.3-201ENST00000564211 3047 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
HACD2Q6Y1H2 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HACD2Q6Y1H2 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HACD2Q6Y1H2 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HACD2Q6Y1H2 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HACD2Q6Y1H2 AC005089.1-201ENST00000619486 2241 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
HACD2Q6Y1H2 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HACD2Q6Y1H2 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HACD2Q6Y1H2 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HACD2Q6Y1H2 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HACD2Q6Y1H2 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HACD2Q6Y1H2 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HACD2Q6Y1H2 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HACD2Q6Y1H2 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HACD2Q6Y1H2 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HACD2Q6Y1H2 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HACD2Q6Y1H2 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HACD2Q6Y1H2 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HACD2Q6Y1H2 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HACD2Q6Y1H2 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HACD2Q6Y1H2 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HACD2Q6Y1H2 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HACD2Q6Y1H2 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HACD2Q6Y1H2 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HACD2Q6Y1H2 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HACD2Q6Y1H2 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HACD2Q6Y1H2 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HACD2Q6Y1H2 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
HACD2Q6Y1H2 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
HACD2Q6Y1H2 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HACD2Q6Y1H2 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HACD2Q6Y1H2 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HACD2Q6Y1H2 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HACD2Q6Y1H2 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
HACD2Q6Y1H2 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HACD2Q6Y1H2 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HACD2Q6Y1H2 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
HACD2Q6Y1H2 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
HACD2Q6Y1H2 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HACD2Q6Y1H2 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
HACD2Q6Y1H2 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
HACD2Q6Y1H2 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HACD2Q6Y1H2 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HACD2Q6Y1H2 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HACD2Q6Y1H2 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HACD2Q6Y1H2 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HACD2Q6Y1H2 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HACD2Q6Y1H2 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HACD2Q6Y1H2 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HACD2Q6Y1H2 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HACD2Q6Y1H2 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HACD2Q6Y1H2 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HACD2Q6Y1H2 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HACD2Q6Y1H2 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
HACD2Q6Y1H2 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HACD2Q6Y1H2 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HACD2Q6Y1H2 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HACD2Q6Y1H2 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HACD2Q6Y1H2 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HACD2Q6Y1H2 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
HACD2Q6Y1H2 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HACD2Q6Y1H2 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HACD2Q6Y1H2 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HACD2Q6Y1H2 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HACD2Q6Y1H2 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
HACD2Q6Y1H2 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HACD2Q6Y1H2 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HACD2Q6Y1H2 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HACD2Q6Y1H2 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HACD2Q6Y1H2 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HACD2Q6Y1H2 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.9 ms