Protein–RNA interactions for Protein: Q3C1V8

BSX, Brain-specific homeobox protein homolog, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BSXQ3C1V8 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
BSXQ3C1V8 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
BSXQ3C1V8 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
BSXQ3C1V8 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
BSXQ3C1V8 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
BSXQ3C1V8 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
BSXQ3C1V8 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
BSXQ3C1V8 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
BSXQ3C1V8 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
BSXQ3C1V8 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
BSXQ3C1V8 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
BSXQ3C1V8 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC13.14□□□□□ -0.31
BSXQ3C1V8 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
BSXQ3C1V8 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
BSXQ3C1V8 PHAX-201ENST00000297540 4288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
BSXQ3C1V8 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
BSXQ3C1V8 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
BSXQ3C1V8 EYA4-205ENST00000430974 2364 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
BSXQ3C1V8 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
BSXQ3C1V8 OPA1-203ENST00000361715 6384 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
BSXQ3C1V8 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
BSXQ3C1V8 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
BSXQ3C1V8 IRF4-201ENST00000380956 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
BSXQ3C1V8 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
BSXQ3C1V8 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
BSXQ3C1V8 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
BSXQ3C1V8 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
BSXQ3C1V8 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
BSXQ3C1V8 SMARCA4-214ENST00000589677 5181 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
BSXQ3C1V8 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
BSXQ3C1V8 CDK5RAP2-202ENST00000360190 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
BSXQ3C1V8 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
BSXQ3C1V8 CEP170B-204ENST00000556508 6683 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
BSXQ3C1V8 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
BSXQ3C1V8 TBC1D2-201ENST00000342112 3046 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
BSXQ3C1V8 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
BSXQ3C1V8 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
BSXQ3C1V8 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
BSXQ3C1V8 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
BSXQ3C1V8 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
BSXQ3C1V8 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
BSXQ3C1V8 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
BSXQ3C1V8 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
BSXQ3C1V8 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
BSXQ3C1V8 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
BSXQ3C1V8 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
BSXQ3C1V8 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
BSXQ3C1V8 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
BSXQ3C1V8 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
BSXQ3C1V8 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
BSXQ3C1V8 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
BSXQ3C1V8 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
BSXQ3C1V8 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
BSXQ3C1V8 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
BSXQ3C1V8 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
BSXQ3C1V8 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
BSXQ3C1V8 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
BSXQ3C1V8 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
BSXQ3C1V8 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
BSXQ3C1V8 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
BSXQ3C1V8 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
BSXQ3C1V8 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
BSXQ3C1V8 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
BSXQ3C1V8 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
BSXQ3C1V8 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
BSXQ3C1V8 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
BSXQ3C1V8 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
BSXQ3C1V8 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
BSXQ3C1V8 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
BSXQ3C1V8 SFI1-209ENST00000443011 3579 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
BSXQ3C1V8 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
BSXQ3C1V8 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
BSXQ3C1V8 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
BSXQ3C1V8 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
BSXQ3C1V8 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
BSXQ3C1V8 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
BSXQ3C1V8 C3-201ENST00000245907 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
BSXQ3C1V8 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
BSXQ3C1V8 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
BSXQ3C1V8 SPATA6-204ENST00000396199 4964 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
BSXQ3C1V8 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
BSXQ3C1V8 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
BSXQ3C1V8 GRM1-201ENST00000282753 6622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
BSXQ3C1V8 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
BSXQ3C1V8 FAM219A-204ENST00000379081 3543 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
BSXQ3C1V8 SH2D3C-206ENST00000429553 2794 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
BSXQ3C1V8 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
BSXQ3C1V8 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
BSXQ3C1V8 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
BSXQ3C1V8 CPEB3-201ENST00000265997 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
BSXQ3C1V8 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
BSXQ3C1V8 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
BSXQ3C1V8 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
BSXQ3C1V8 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
BSXQ3C1V8 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
BSXQ3C1V8 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
BSXQ3C1V8 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
BSXQ3C1V8 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
BSXQ3C1V8 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
BSXQ3C1V8 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms