Protein–RNA interactions for Protein: Q2M1V0

ISX, Intestine-specific homeobox, humanhuman

Predictions only

Length 245 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ISXQ2M1V0 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ISXQ2M1V0 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ISXQ2M1V0 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ISXQ2M1V0 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ISXQ2M1V0 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ISXQ2M1V0 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ISXQ2M1V0 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ISXQ2M1V0 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ISXQ2M1V0 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ISXQ2M1V0 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ISXQ2M1V0 BOLA2P3-201ENST00000404566 256 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
ISXQ2M1V0 CHMP2B-205ENST00000494980 1175 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ISXQ2M1V0 AC012574.2-201ENST00000520375 443 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ISXQ2M1V0 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ISXQ2M1V0 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ISXQ2M1V0 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ISXQ2M1V0 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ISXQ2M1V0 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
ISXQ2M1V0 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ISXQ2M1V0 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ISXQ2M1V0 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ISXQ2M1V0 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ISXQ2M1V0 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ISXQ2M1V0 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ISXQ2M1V0 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ISXQ2M1V0 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ISXQ2M1V0 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ISXQ2M1V0 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ISXQ2M1V0 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ISXQ2M1V0 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ISXQ2M1V0 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ISXQ2M1V0 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ISXQ2M1V0 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ISXQ2M1V0 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ISXQ2M1V0 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ISXQ2M1V0 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ISXQ2M1V0 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ISXQ2M1V0 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ISXQ2M1V0 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ISXQ2M1V0 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ISXQ2M1V0 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ISXQ2M1V0 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ISXQ2M1V0 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ISXQ2M1V0 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ISXQ2M1V0 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ISXQ2M1V0 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ISXQ2M1V0 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ISXQ2M1V0 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ISXQ2M1V0 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ISXQ2M1V0 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ISXQ2M1V0 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ISXQ2M1V0 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ISXQ2M1V0 AL450998.2-201ENST00000418525 639 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ISXQ2M1V0 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
ISXQ2M1V0 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
ISXQ2M1V0 SNX29P1-201ENST00000548357 1007 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
ISXQ2M1V0 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ISXQ2M1V0 AC135178.3-201ENST00000583963 531 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ISXQ2M1V0 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ISXQ2M1V0 FLT3LG-205ENST00000596435 1034 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ISXQ2M1V0 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ISXQ2M1V0 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ISXQ2M1V0 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ISXQ2M1V0 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ISXQ2M1V0 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ISXQ2M1V0 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
ISXQ2M1V0 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ISXQ2M1V0 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ISXQ2M1V0 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ISXQ2M1V0 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ISXQ2M1V0 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ISXQ2M1V0 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ISXQ2M1V0 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ISXQ2M1V0 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ISXQ2M1V0 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ISXQ2M1V0 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ISXQ2M1V0 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ISXQ2M1V0 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ISXQ2M1V0 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ISXQ2M1V0 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ISXQ2M1V0 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ISXQ2M1V0 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ISXQ2M1V0 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ISXQ2M1V0 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ISXQ2M1V0 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ISXQ2M1V0 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ISXQ2M1V0 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ISXQ2M1V0 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ISXQ2M1V0 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ISXQ2M1V0 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ISXQ2M1V0 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ISXQ2M1V0 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ISXQ2M1V0 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ISXQ2M1V0 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ISXQ2M1V0 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
ISXQ2M1V0 H2BFM-203ENST00000598335 465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ISXQ2M1V0 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
ISXQ2M1V0 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ISXQ2M1V0 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ISXQ2M1V0 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.1 ms