Protein–RNA interactions for Protein: Q16827

PTPRO, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase O, humanhuman

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Length 1,216 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPROQ16827 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTPROQ16827 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTPROQ16827 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTPROQ16827 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
PTPROQ16827 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTPROQ16827 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTPROQ16827 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTPROQ16827 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTPROQ16827 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTPROQ16827 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTPROQ16827 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
PTPROQ16827 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTPROQ16827 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTPROQ16827 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTPROQ16827 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTPROQ16827 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTPROQ16827 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTPROQ16827 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTPROQ16827 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PTPROQ16827 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PTPROQ16827 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PTPROQ16827 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PTPROQ16827 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PTPROQ16827 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PTPROQ16827 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PTPROQ16827 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PTPROQ16827 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PTPROQ16827 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PTPROQ16827 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PTPROQ16827 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
PTPROQ16827 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PTPROQ16827 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PTPROQ16827 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PTPROQ16827 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
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PTPROQ16827 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PTPROQ16827 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
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PTPROQ16827 GPR53P-205ENST00000457298 1084 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
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PTPROQ16827 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
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PTPROQ16827 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
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PTPROQ16827 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
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PTPROQ16827 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
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PTPROQ16827 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
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PTPROQ16827 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
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PTPROQ16827 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
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PTPROQ16827 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PTPROQ16827 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PTPROQ16827 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PTPROQ16827 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PTPROQ16827 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PTPROQ16827 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PTPROQ16827 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
PTPROQ16827 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PTPROQ16827 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PTPROQ16827 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PTPROQ16827 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
PTPROQ16827 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
PTPROQ16827 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
PTPROQ16827 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
PTPROQ16827 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PTPROQ16827 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PTPROQ16827 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PTPROQ16827 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PTPROQ16827 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PTPROQ16827 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
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