Protein–RNA interactions for Protein: Q16740

CLPP, ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 277 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLPPQ16740 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CLPPQ16740 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CLPPQ16740 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CLPPQ16740 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CLPPQ16740 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CLPPQ16740 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CLPPQ16740 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CLPPQ16740 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CLPPQ16740 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CLPPQ16740 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CLPPQ16740 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CLPPQ16740 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
CLPPQ16740 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CLPPQ16740 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CLPPQ16740 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CLPPQ16740 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
CLPPQ16740 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CLPPQ16740 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CLPPQ16740 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CLPPQ16740 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CLPPQ16740 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CLPPQ16740 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CLPPQ16740 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CLPPQ16740 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.1
CLPPQ16740 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
CLPPQ16740 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
CLPPQ16740 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CLPPQ16740 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CLPPQ16740 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CLPPQ16740 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CLPPQ16740 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CLPPQ16740 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CLPPQ16740 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CLPPQ16740 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CLPPQ16740 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CLPPQ16740 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CLPPQ16740 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CLPPQ16740 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CLPPQ16740 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CLPPQ16740 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CLPPQ16740 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
CLPPQ16740 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CLPPQ16740 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CLPPQ16740 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
CLPPQ16740 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CLPPQ16740 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CLPPQ16740 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CLPPQ16740 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
CLPPQ16740 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CLPPQ16740 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CLPPQ16740 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
CLPPQ16740 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CLPPQ16740 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
CLPPQ16740 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
CLPPQ16740 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
CLPPQ16740 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CLPPQ16740 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
CLPPQ16740 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
CLPPQ16740 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
CLPPQ16740 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
CLPPQ16740 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
CLPPQ16740 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CLPPQ16740 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CLPPQ16740 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CLPPQ16740 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CLPPQ16740 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CLPPQ16740 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CLPPQ16740 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CLPPQ16740 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CLPPQ16740 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
CLPPQ16740 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CLPPQ16740 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CLPPQ16740 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CLPPQ16740 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CLPPQ16740 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CLPPQ16740 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLPPQ16740 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLPPQ16740 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLPPQ16740 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLPPQ16740 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLPPQ16740 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLPPQ16740 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLPPQ16740 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLPPQ16740 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLPPQ16740 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLPPQ16740 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLPPQ16740 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLPPQ16740 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLPPQ16740 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLPPQ16740 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLPPQ16740 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLPPQ16740 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLPPQ16740 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CLPPQ16740 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLPPQ16740 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLPPQ16740 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLPPQ16740 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLPPQ16740 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLPPQ16740 TRIM46-210ENST00000545012 2979 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLPPQ16740 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
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