Protein–RNA interactions for Protein: Q15904

ATP6AP1, V-type proton ATPase subunit S1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP6AP1Q15904 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ATP6AP1Q15904 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ATP6AP1Q15904 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ATP6AP1Q15904 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ATP6AP1Q15904 PDE1B-207ENST00000550620 2150 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ATP6AP1Q15904 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ATP6AP1Q15904 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ATP6AP1Q15904 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ATP6AP1Q15904 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ATP6AP1Q15904 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ATP6AP1Q15904 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ATP6AP1Q15904 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ATP6AP1Q15904 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ATP6AP1Q15904 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
ATP6AP1Q15904 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ATP6AP1Q15904 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ATP6AP1Q15904 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ATP6AP1Q15904 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
ATP6AP1Q15904 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ATP6AP1Q15904 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
ATP6AP1Q15904 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ATP6AP1Q15904 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ATP6AP1Q15904 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ATP6AP1Q15904 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ATP6AP1Q15904 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ATP6AP1Q15904 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ATP6AP1Q15904 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ATP6AP1Q15904 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ATP6AP1Q15904 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ATP6AP1Q15904 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ATP6AP1Q15904 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ATP6AP1Q15904 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ATP6AP1Q15904 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ATP6AP1Q15904 POLL-206ENST00000370172 2308 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ATP6AP1Q15904 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ATP6AP1Q15904 AC104581.4-201ENST00000623126 3052 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
ATP6AP1Q15904 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ATP6AP1Q15904 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ATP6AP1Q15904 WDR20-203ENST00000335263 2616 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ATP6AP1Q15904 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ATP6AP1Q15904 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ATP6AP1Q15904 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ATP6AP1Q15904 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ATP6AP1Q15904 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATP6AP1Q15904 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATP6AP1Q15904 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATP6AP1Q15904 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATP6AP1Q15904 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATP6AP1Q15904 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATP6AP1Q15904 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATP6AP1Q15904 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATP6AP1Q15904 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATP6AP1Q15904 XRCC1-201ENST00000262887 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATP6AP1Q15904 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATP6AP1Q15904 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATP6AP1Q15904 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATP6AP1Q15904 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATP6AP1Q15904 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATP6AP1Q15904 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATP6AP1Q15904 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATP6AP1Q15904 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATP6AP1Q15904 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATP6AP1Q15904 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATP6AP1Q15904 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATP6AP1Q15904 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
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ATP6AP1Q15904 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATP6AP1Q15904 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
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ATP6AP1Q15904 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATP6AP1Q15904 SLC11A2-204ENST00000541174 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATP6AP1Q15904 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATP6AP1Q15904 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATP6AP1Q15904 VLDLR-202ENST00000382099 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATP6AP1Q15904 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATP6AP1Q15904 DMTN-203ENST00000381470 2601 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATP6AP1Q15904 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
ATP6AP1Q15904 CEP78-203ENST00000376598 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
ATP6AP1Q15904 AC005912.2-201ENST00000619492 2400 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
ATP6AP1Q15904 SHC1-204ENST00000368450 3059 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ATP6AP1Q15904 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ATP6AP1Q15904 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ATP6AP1Q15904 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
ATP6AP1Q15904 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ATP6AP1Q15904 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ATP6AP1Q15904 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ATP6AP1Q15904 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ATP6AP1Q15904 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ATP6AP1Q15904 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ATP6AP1Q15904 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
ATP6AP1Q15904 DMTN-205ENST00000432128 2508 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
ATP6AP1Q15904 MBD1-212ENST00000585672 2532 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ATP6AP1Q15904 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ATP6AP1Q15904 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ATP6AP1Q15904 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ATP6AP1Q15904 CNPY1-203ENST00000636372 2259 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ATP6AP1Q15904 DIAPH2-204ENST00000373054 3376 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ATP6AP1Q15904 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ATP6AP1Q15904 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ATP6AP1Q15904 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
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