Protein–RNA interactions for Protein: Q15059

BRD3, Bromodomain-containing protein 3, humanhuman

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Length 726 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRD3Q15059 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
BRD3Q15059 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
BRD3Q15059 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
BRD3Q15059 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
BRD3Q15059 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
BRD3Q15059 CEP78-203ENST00000376598 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
BRD3Q15059 TMPRSS3-204ENST00000433957 2403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
BRD3Q15059 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
BRD3Q15059 NYAP1-201ENST00000300179 3581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
BRD3Q15059 ATXN10-202ENST00000381061 3135 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
BRD3Q15059 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
BRD3Q15059 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
BRD3Q15059 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
BRD3Q15059 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
BRD3Q15059 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
BRD3Q15059 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
BRD3Q15059 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
BRD3Q15059 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
BRD3Q15059 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
BRD3Q15059 TSC22D1-211ENST00000501704 4026 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
BRD3Q15059 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
BRD3Q15059 UBAP1-202ENST00000359544 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
BRD3Q15059 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
BRD3Q15059 PDE1B-207ENST00000550620 2150 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
BRD3Q15059 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
BRD3Q15059 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
BRD3Q15059 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
BRD3Q15059 NRP2-203ENST00000357785 2926 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
BRD3Q15059 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
BRD3Q15059 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
BRD3Q15059 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
BRD3Q15059 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
BRD3Q15059 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
BRD3Q15059 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
BRD3Q15059 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
BRD3Q15059 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
BRD3Q15059 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
BRD3Q15059 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
BRD3Q15059 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
BRD3Q15059 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
BRD3Q15059 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
BRD3Q15059 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
BRD3Q15059 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
BRD3Q15059 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
BRD3Q15059 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
BRD3Q15059 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
BRD3Q15059 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
BRD3Q15059 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
BRD3Q15059 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
BRD3Q15059 TPD52L2-202ENST00000346249 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
BRD3Q15059 FLI1-207ENST00000534087 3859 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
BRD3Q15059 NFATC1-218ENST00000592223 2531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
BRD3Q15059 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
BRD3Q15059 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
BRD3Q15059 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
BRD3Q15059 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
BRD3Q15059 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
BRD3Q15059 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
BRD3Q15059 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
BRD3Q15059 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
BRD3Q15059 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
BRD3Q15059 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
BRD3Q15059 BCAR1-204ENST00000418647 3387 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
BRD3Q15059 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
BRD3Q15059 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
BRD3Q15059 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
BRD3Q15059 PAPOLA-223ENST00000557320 3264 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
BRD3Q15059 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
BRD3Q15059 DMTN-205ENST00000432128 2508 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
BRD3Q15059 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
BRD3Q15059 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
BRD3Q15059 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
BRD3Q15059 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
BRD3Q15059 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
BRD3Q15059 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
BRD3Q15059 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
BRD3Q15059 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
BRD3Q15059 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
BRD3Q15059 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
BRD3Q15059 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
BRD3Q15059 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
BRD3Q15059 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
BRD3Q15059 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
BRD3Q15059 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
BRD3Q15059 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
BRD3Q15059 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
BRD3Q15059 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
BRD3Q15059 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
BRD3Q15059 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
BRD3Q15059 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
BRD3Q15059 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
BRD3Q15059 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
BRD3Q15059 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
BRD3Q15059 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
BRD3Q15059 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
BRD3Q15059 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
BRD3Q15059 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
BRD3Q15059 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
BRD3Q15059 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
BRD3Q15059 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
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