Protein–RNA interactions for Protein: Q14156

EFR3A, Protein EFR3 homolog A, humanhuman

Predictions only

Length 821 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFR3AQ14156 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
EFR3AQ14156 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
EFR3AQ14156 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
EFR3AQ14156 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
EFR3AQ14156 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
EFR3AQ14156 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
EFR3AQ14156 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
EFR3AQ14156 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
EFR3AQ14156 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
EFR3AQ14156 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
EFR3AQ14156 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
EFR3AQ14156 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
EFR3AQ14156 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
EFR3AQ14156 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
EFR3AQ14156 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
EFR3AQ14156 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
EFR3AQ14156 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
EFR3AQ14156 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
EFR3AQ14156 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
EFR3AQ14156 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
EFR3AQ14156 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
EFR3AQ14156 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
EFR3AQ14156 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
EFR3AQ14156 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
EFR3AQ14156 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
EFR3AQ14156 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
EFR3AQ14156 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
EFR3AQ14156 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
EFR3AQ14156 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
EFR3AQ14156 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
EFR3AQ14156 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
EFR3AQ14156 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
EFR3AQ14156 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
EFR3AQ14156 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
EFR3AQ14156 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
EFR3AQ14156 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
EFR3AQ14156 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
EFR3AQ14156 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
EFR3AQ14156 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
EFR3AQ14156 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
EFR3AQ14156 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
EFR3AQ14156 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
EFR3AQ14156 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
EFR3AQ14156 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
EFR3AQ14156 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
EFR3AQ14156 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
EFR3AQ14156 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
EFR3AQ14156 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
EFR3AQ14156 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
EFR3AQ14156 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
EFR3AQ14156 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
EFR3AQ14156 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
EFR3AQ14156 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
EFR3AQ14156 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
EFR3AQ14156 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
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EFR3AQ14156 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
EFR3AQ14156 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
EFR3AQ14156 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
EFR3AQ14156 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
EFR3AQ14156 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
EFR3AQ14156 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
EFR3AQ14156 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
EFR3AQ14156 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
EFR3AQ14156 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
EFR3AQ14156 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
EFR3AQ14156 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
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EFR3AQ14156 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
EFR3AQ14156 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
EFR3AQ14156 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
EFR3AQ14156 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
EFR3AQ14156 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
EFR3AQ14156 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
EFR3AQ14156 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
EFR3AQ14156 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
EFR3AQ14156 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
EFR3AQ14156 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
EFR3AQ14156 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
EFR3AQ14156 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
EFR3AQ14156 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
EFR3AQ14156 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
EFR3AQ14156 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
EFR3AQ14156 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
EFR3AQ14156 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
EFR3AQ14156 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
EFR3AQ14156 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
EFR3AQ14156 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
EFR3AQ14156 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
EFR3AQ14156 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
EFR3AQ14156 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
EFR3AQ14156 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
EFR3AQ14156 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
EFR3AQ14156 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
EFR3AQ14156 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
EFR3AQ14156 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.6 ms