Protein–RNA interactions for Protein: Q13889

GTF2H3, General transcription factor IIH subunit 3, humanhuman

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Length 308 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2H3Q13889 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GTF2H3Q13889 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
GTF2H3Q13889 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GTF2H3Q13889 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GTF2H3Q13889 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GTF2H3Q13889 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GTF2H3Q13889 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GTF2H3Q13889 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GTF2H3Q13889 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GTF2H3Q13889 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GTF2H3Q13889 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GTF2H3Q13889 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GTF2H3Q13889 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GTF2H3Q13889 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GTF2H3Q13889 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GTF2H3Q13889 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GTF2H3Q13889 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GTF2H3Q13889 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GTF2H3Q13889 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GTF2H3Q13889 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GTF2H3Q13889 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GTF2H3Q13889 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GTF2H3Q13889 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GTF2H3Q13889 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GTF2H3Q13889 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GTF2H3Q13889 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GTF2H3Q13889 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GTF2H3Q13889 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GTF2H3Q13889 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GTF2H3Q13889 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GTF2H3Q13889 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GTF2H3Q13889 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GTF2H3Q13889 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GTF2H3Q13889 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GTF2H3Q13889 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
GTF2H3Q13889 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GTF2H3Q13889 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GTF2H3Q13889 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GTF2H3Q13889 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GTF2H3Q13889 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GTF2H3Q13889 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GTF2H3Q13889 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GTF2H3Q13889 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GTF2H3Q13889 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GTF2H3Q13889 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GTF2H3Q13889 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GTF2H3Q13889 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GTF2H3Q13889 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GTF2H3Q13889 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GTF2H3Q13889 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GTF2H3Q13889 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GTF2H3Q13889 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GTF2H3Q13889 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GTF2H3Q13889 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GTF2H3Q13889 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GTF2H3Q13889 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GTF2H3Q13889 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GTF2H3Q13889 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GTF2H3Q13889 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GTF2H3Q13889 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GTF2H3Q13889 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
GTF2H3Q13889 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
GTF2H3Q13889 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
GTF2H3Q13889 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.18
GTF2H3Q13889 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC16.14■□□□□ 0.18
GTF2H3Q13889 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
GTF2H3Q13889 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GTF2H3Q13889 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GTF2H3Q13889 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GTF2H3Q13889 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GTF2H3Q13889 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GTF2H3Q13889 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GTF2H3Q13889 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GTF2H3Q13889 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GTF2H3Q13889 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GTF2H3Q13889 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GTF2H3Q13889 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GTF2H3Q13889 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GTF2H3Q13889 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GTF2H3Q13889 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GTF2H3Q13889 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GTF2H3Q13889 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
GTF2H3Q13889 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GTF2H3Q13889 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GTF2H3Q13889 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GTF2H3Q13889 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GTF2H3Q13889 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GTF2H3Q13889 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GTF2H3Q13889 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
GTF2H3Q13889 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GTF2H3Q13889 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GTF2H3Q13889 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GTF2H3Q13889 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GTF2H3Q13889 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GTF2H3Q13889 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GTF2H3Q13889 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GTF2H3Q13889 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GTF2H3Q13889 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GTF2H3Q13889 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GTF2H3Q13889 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.4 ms