Protein–RNA interactions for Protein: Q13797

ITGA9, Integrin alpha-9, humanhuman

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Length 1,035 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA9Q13797 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ITGA9Q13797 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ITGA9Q13797 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ITGA9Q13797 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ITGA9Q13797 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ITGA9Q13797 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
ITGA9Q13797 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ITGA9Q13797 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ITGA9Q13797 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ITGA9Q13797 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ITGA9Q13797 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
ITGA9Q13797 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ITGA9Q13797 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
ITGA9Q13797 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ITGA9Q13797 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ITGA9Q13797 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ITGA9Q13797 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ITGA9Q13797 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ITGA9Q13797 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ITGA9Q13797 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
ITGA9Q13797 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ITGA9Q13797 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ITGA9Q13797 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ITGA9Q13797 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ITGA9Q13797 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ITGA9Q13797 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ITGA9Q13797 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ITGA9Q13797 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ITGA9Q13797 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ITGA9Q13797 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ITGA9Q13797 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
ITGA9Q13797 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
ITGA9Q13797 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
ITGA9Q13797 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ITGA9Q13797 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ITGA9Q13797 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ITGA9Q13797 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ITGA9Q13797 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ITGA9Q13797 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ITGA9Q13797 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ITGA9Q13797 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ITGA9Q13797 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ITGA9Q13797 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ITGA9Q13797 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ITGA9Q13797 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ITGA9Q13797 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ITGA9Q13797 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ITGA9Q13797 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ITGA9Q13797 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ITGA9Q13797 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ITGA9Q13797 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ITGA9Q13797 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
ITGA9Q13797 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
ITGA9Q13797 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
ITGA9Q13797 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
ITGA9Q13797 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ITGA9Q13797 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ITGA9Q13797 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
ITGA9Q13797 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ITGA9Q13797 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ITGA9Q13797 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ITGA9Q13797 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
ITGA9Q13797 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ITGA9Q13797 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ITGA9Q13797 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ITGA9Q13797 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ITGA9Q13797 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ITGA9Q13797 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ITGA9Q13797 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ITGA9Q13797 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ITGA9Q13797 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ITGA9Q13797 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ITGA9Q13797 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
ITGA9Q13797 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ITGA9Q13797 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ITGA9Q13797 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ITGA9Q13797 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ITGA9Q13797 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ITGA9Q13797 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ITGA9Q13797 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ITGA9Q13797 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ITGA9Q13797 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ITGA9Q13797 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ITGA9Q13797 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ITGA9Q13797 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ITGA9Q13797 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ITGA9Q13797 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ITGA9Q13797 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ITGA9Q13797 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ITGA9Q13797 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ITGA9Q13797 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ITGA9Q13797 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ITGA9Q13797 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ITGA9Q13797 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ITGA9Q13797 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ITGA9Q13797 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ITGA9Q13797 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ITGA9Q13797 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
ITGA9Q13797 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ITGA9Q13797 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
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