Protein–RNA interactions for Protein: Q13084

MRPL28, 39S ribosomal protein L28, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 256 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPL28Q13084 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
MRPL28Q13084 CA12-201ENST00000178638 6413 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
MRPL28Q13084 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
MRPL28Q13084 ZNF74-209ENST00000611540 3714 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
MRPL28Q13084 ADAMTS13-205ENST00000371916 4330 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
MRPL28Q13084 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
MRPL28Q13084 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
MRPL28Q13084 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
MRPL28Q13084 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
MRPL28Q13084 MAPKAPK5-206ENST00000550735 11349 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
MRPL28Q13084 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
MRPL28Q13084 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
MRPL28Q13084 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
MRPL28Q13084 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
MRPL28Q13084 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
MRPL28Q13084 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
MRPL28Q13084 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
MRPL28Q13084 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
MRPL28Q13084 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
MRPL28Q13084 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
MRPL28Q13084 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
MRPL28Q13084 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
MRPL28Q13084 PITPNM1-216ENST00000534749 4189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
MRPL28Q13084 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
MRPL28Q13084 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
MRPL28Q13084 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
MRPL28Q13084 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
MRPL28Q13084 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
MRPL28Q13084 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
MRPL28Q13084 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
MRPL28Q13084 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
MRPL28Q13084 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
MRPL28Q13084 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
MRPL28Q13084 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC14.68□□□□□ -0.06
MRPL28Q13084 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
MRPL28Q13084 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
MRPL28Q13084 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
MRPL28Q13084 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
MRPL28Q13084 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
MRPL28Q13084 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
MRPL28Q13084 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
MRPL28Q13084 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
MRPL28Q13084 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
MRPL28Q13084 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
MRPL28Q13084 B3GAT1-203ENST00000524765 5737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
MRPL28Q13084 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
MRPL28Q13084 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
MRPL28Q13084 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
MRPL28Q13084 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
MRPL28Q13084 PTPN23-201ENST00000265562 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
MRPL28Q13084 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
MRPL28Q13084 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
MRPL28Q13084 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
MRPL28Q13084 TRIM56-201ENST00000306085 10952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
MRPL28Q13084 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
MRPL28Q13084 SUSD5-201ENST00000309558 5008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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MRPL28Q13084 SH2D3C-206ENST00000429553 2794 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
MRPL28Q13084 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
MRPL28Q13084 CFAP46-202ENST00000368586 8278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
MRPL28Q13084 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
MRPL28Q13084 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
MRPL28Q13084 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
MRPL28Q13084 NRXN1-222ENST00000625672 8113 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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MRPL28Q13084 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
MRPL28Q13084 CMTR2-201ENST00000338099 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
MRPL28Q13084 FERMT3-201ENST00000279227 2489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
MRPL28Q13084 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
MRPL28Q13084 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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MRPL28Q13084 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
MRPL28Q13084 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
MRPL28Q13084 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
MRPL28Q13084 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
MRPL28Q13084 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
MRPL28Q13084 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
MRPL28Q13084 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
MRPL28Q13084 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
MRPL28Q13084 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
MRPL28Q13084 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
MRPL28Q13084 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
MRPL28Q13084 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
MRPL28Q13084 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
MRPL28Q13084 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
MRPL28Q13084 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
MRPL28Q13084 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
MRPL28Q13084 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
MRPL28Q13084 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
MRPL28Q13084 CGN-201ENST00000271636 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
MRPL28Q13084 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
MRPL28Q13084 GPR137C-201ENST00000321662 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
MRPL28Q13084 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
MRPL28Q13084 NDC1-201ENST00000371429 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
MRPL28Q13084 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
MRPL28Q13084 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
MRPL28Q13084 COL17A1-201ENST00000353479 5734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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