Protein–RNA interactions for Protein: Q0VAM2

RASGEF1B, Ras-GEF domain-containing family member 1B, humanhuman

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Length 473 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RASGEF1BQ0VAM2 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RASGEF1BQ0VAM2 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RASGEF1BQ0VAM2 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
RASGEF1BQ0VAM2 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
RASGEF1BQ0VAM2 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
RASGEF1BQ0VAM2 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RASGEF1BQ0VAM2 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
RASGEF1BQ0VAM2 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RASGEF1BQ0VAM2 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RASGEF1BQ0VAM2 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
RASGEF1BQ0VAM2 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RASGEF1BQ0VAM2 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
RASGEF1BQ0VAM2 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
RASGEF1BQ0VAM2 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RASGEF1BQ0VAM2 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RASGEF1BQ0VAM2 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RASGEF1BQ0VAM2 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
RASGEF1BQ0VAM2 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
RASGEF1BQ0VAM2 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
RASGEF1BQ0VAM2 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
RASGEF1BQ0VAM2 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
RASGEF1BQ0VAM2 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
RASGEF1BQ0VAM2 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
RASGEF1BQ0VAM2 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
RASGEF1BQ0VAM2 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
RASGEF1BQ0VAM2 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
RASGEF1BQ0VAM2 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
RASGEF1BQ0VAM2 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
RASGEF1BQ0VAM2 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC14.75□□□□□ -0.05
RASGEF1BQ0VAM2 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RASGEF1BQ0VAM2 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
RASGEF1BQ0VAM2 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
RASGEF1BQ0VAM2 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
RASGEF1BQ0VAM2 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RASGEF1BQ0VAM2 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
RASGEF1BQ0VAM2 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RASGEF1BQ0VAM2 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RASGEF1BQ0VAM2 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RASGEF1BQ0VAM2 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
RASGEF1BQ0VAM2 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
RASGEF1BQ0VAM2 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.75□□□□□ -0.05
RASGEF1BQ0VAM2 TRIM71-201ENST00000383763 8685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RASGEF1BQ0VAM2 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RASGEF1BQ0VAM2 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RASGEF1BQ0VAM2 NFATC4-206ENST00000539237 5686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RASGEF1BQ0VAM2 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RASGEF1BQ0VAM2 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RASGEF1BQ0VAM2 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RASGEF1BQ0VAM2 PPL-205ENST00000590782 5845 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
RASGEF1BQ0VAM2 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
RASGEF1BQ0VAM2 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RASGEF1BQ0VAM2 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
RASGEF1BQ0VAM2 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
RASGEF1BQ0VAM2 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RASGEF1BQ0VAM2 NTRK2-201ENST00000277120 8633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RASGEF1BQ0VAM2 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
RASGEF1BQ0VAM2 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RASGEF1BQ0VAM2 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC14.74□□□□□ -0.05
RASGEF1BQ0VAM2 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RASGEF1BQ0VAM2 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
RASGEF1BQ0VAM2 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
RASGEF1BQ0VAM2 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RASGEF1BQ0VAM2 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
RASGEF1BQ0VAM2 DENND5B-202ENST00000389082 9470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
RASGEF1BQ0VAM2 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RASGEF1BQ0VAM2 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RASGEF1BQ0VAM2 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RASGEF1BQ0VAM2 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
RASGEF1BQ0VAM2 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
RASGEF1BQ0VAM2 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
RASGEF1BQ0VAM2 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
RASGEF1BQ0VAM2 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
RASGEF1BQ0VAM2 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
RASGEF1BQ0VAM2 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
RASGEF1BQ0VAM2 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
RASGEF1BQ0VAM2 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
RASGEF1BQ0VAM2 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
RASGEF1BQ0VAM2 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC14.74□□□□□ -0.05
RASGEF1BQ0VAM2 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
RASGEF1BQ0VAM2 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
RASGEF1BQ0VAM2 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
RASGEF1BQ0VAM2 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
RASGEF1BQ0VAM2 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
RASGEF1BQ0VAM2 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
RASGEF1BQ0VAM2 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
RASGEF1BQ0VAM2 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
RASGEF1BQ0VAM2 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RASGEF1BQ0VAM2 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
RASGEF1BQ0VAM2 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RASGEF1BQ0VAM2 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RASGEF1BQ0VAM2 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
RASGEF1BQ0VAM2 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RASGEF1BQ0VAM2 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RASGEF1BQ0VAM2 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RASGEF1BQ0VAM2 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RASGEF1BQ0VAM2 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
RASGEF1BQ0VAM2 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RASGEF1BQ0VAM2 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RASGEF1BQ0VAM2 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RASGEF1BQ0VAM2 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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