Protein–RNA interactions for Protein: Q04900

CD164, Sialomucin core protein 24, humanhuman

Predictions only

Length 197 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD164Q04900 STK25-235ENST00000543554 2556 ntTSL 2 BASIC9.74□□□□□ -0.85
CD164Q04900 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
CD164Q04900 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
CD164Q04900 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
CD164Q04900 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC9.74□□□□□ -0.85
CD164Q04900 TIFA-201ENST00000361717 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
CD164Q04900 SLC26A11-201ENST00000361193 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
CD164Q04900 SLC26A11-202ENST00000411502 2872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.74□□□□□ -0.85
CD164Q04900 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
CD164Q04900 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
CD164Q04900 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC9.74□□□□□ -0.85
CD164Q04900 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC9.74□□□□□ -0.85
CD164Q04900 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
CD164Q04900 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
CD164Q04900 MED20-201ENST00000265350 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
CD164Q04900 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
CD164Q04900 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
CD164Q04900 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC9.74□□□□□ -0.85
CD164Q04900 KCNT1-212ENST00000628528 7057 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.74□□□□□ -0.85
CD164Q04900 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
CD164Q04900 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
CD164Q04900 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
CD164Q04900 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.74□□□□□ -0.85
CD164Q04900 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC9.74□□□□□ -0.85
CD164Q04900 SLC25A18-201ENST00000327451 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
CD164Q04900 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC9.74□□□□□ -0.85
CD164Q04900 SIAE-201ENST00000263593 5583 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
CD164Q04900 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
CD164Q04900 CALHM1-201ENST00000329905 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
CD164Q04900 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
CD164Q04900 FNTB-201ENST00000246166 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
CD164Q04900 NTRK2-202ENST00000304053 8226 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
CD164Q04900 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
CD164Q04900 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
CD164Q04900 AKNA-206ENST00000374088 5464 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.73□□□□□ -0.85
CD164Q04900 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
CD164Q04900 ZNF618-207ENST00000615615 9289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
CD164Q04900 UVRAG-201ENST00000356136 4123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
CD164Q04900 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC9.73□□□□□ -0.85
CD164Q04900 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
CD164Q04900 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
CD164Q04900 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
CD164Q04900 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
CD164Q04900 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
CD164Q04900 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
CD164Q04900 ZKSCAN2-201ENST00000328086 7523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
CD164Q04900 STIP1-203ENST00000358794 2743 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
CD164Q04900 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
CD164Q04900 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
CD164Q04900 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC9.73□□□□□ -0.85
CD164Q04900 NCKAP5L-201ENST00000335999 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
CD164Q04900 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
CD164Q04900 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
CD164Q04900 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
CD164Q04900 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC9.73□□□□□ -0.85
CD164Q04900 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.73□□□□□ -0.85
CD164Q04900 PRF1-202ENST00000441259 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
CD164Q04900 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC9.73□□□□□ -0.85
CD164Q04900 MLLT6-211ENST00000621332 7578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
CD164Q04900 KIF26B-202ENST00000407071 7287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
CD164Q04900 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC9.73□□□□□ -0.85
CD164Q04900 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.73□□□□□ -0.85
CD164Q04900 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
CD164Q04900 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC9.73□□□□□ -0.85
CD164Q04900 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC9.73□□□□□ -0.85
CD164Q04900 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
CD164Q04900 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
CD164Q04900 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
CD164Q04900 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC9.73□□□□□ -0.85
CD164Q04900 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC9.73□□□□□ -0.85
CD164Q04900 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC9.73□□□□□ -0.85
CD164Q04900 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC9.73□□□□□ -0.85
CD164Q04900 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
CD164Q04900 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC9.73□□□□□ -0.85
CD164Q04900 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC9.73□□□□□ -0.85
CD164Q04900 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
CD164Q04900 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC9.73□□□□□ -0.85
CD164Q04900 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
CD164Q04900 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
CD164Q04900 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC9.73□□□□□ -0.85
CD164Q04900 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.73□□□□□ -0.85
CD164Q04900 ARHGAP4-201ENST00000350060 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
CD164Q04900 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
CD164Q04900 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC9.73□□□□□ -0.85
CD164Q04900 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC9.73□□□□□ -0.85
CD164Q04900 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
CD164Q04900 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC9.73□□□□□ -0.85
CD164Q04900 RUNX3-203ENST00000399916 4340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.73□□□□□ -0.85
CD164Q04900 ALG1-204ENST00000588623 2671 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
CD164Q04900 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
CD164Q04900 DIAPH2-204ENST00000373054 3376 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
CD164Q04900 HSDL2-202ENST00000398805 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
CD164Q04900 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
CD164Q04900 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
CD164Q04900 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
CD164Q04900 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
CD164Q04900 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
CD164Q04900 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC9.73□□□□□ -0.85
CD164Q04900 MAP3K12-205ENST00000547488 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.73□□□□□ -0.85
CD164Q04900 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms