Protein–RNA interactions for Protein: Q02509

OC90, Otoconin-90, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OC90Q02509 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
OC90Q02509 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
OC90Q02509 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
OC90Q02509 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
OC90Q02509 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
OC90Q02509 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
OC90Q02509 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
OC90Q02509 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
OC90Q02509 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
OC90Q02509 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
OC90Q02509 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
OC90Q02509 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
OC90Q02509 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
OC90Q02509 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
OC90Q02509 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
OC90Q02509 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
OC90Q02509 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
OC90Q02509 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
OC90Q02509 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
OC90Q02509 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
OC90Q02509 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
OC90Q02509 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
OC90Q02509 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
OC90Q02509 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
OC90Q02509 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
OC90Q02509 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
OC90Q02509 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
OC90Q02509 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
OC90Q02509 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
OC90Q02509 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
OC90Q02509 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
OC90Q02509 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
OC90Q02509 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
OC90Q02509 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
OC90Q02509 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
OC90Q02509 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
OC90Q02509 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
OC90Q02509 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
OC90Q02509 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
OC90Q02509 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
OC90Q02509 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
OC90Q02509 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
OC90Q02509 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
OC90Q02509 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
OC90Q02509 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
OC90Q02509 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
OC90Q02509 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
OC90Q02509 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
OC90Q02509 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
OC90Q02509 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
OC90Q02509 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
OC90Q02509 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
OC90Q02509 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
OC90Q02509 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
OC90Q02509 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
OC90Q02509 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
OC90Q02509 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
OC90Q02509 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
OC90Q02509 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
OC90Q02509 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
OC90Q02509 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
OC90Q02509 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
OC90Q02509 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
OC90Q02509 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
OC90Q02509 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
OC90Q02509 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
OC90Q02509 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
OC90Q02509 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
OC90Q02509 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
OC90Q02509 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
OC90Q02509 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
OC90Q02509 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
OC90Q02509 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
OC90Q02509 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
OC90Q02509 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
OC90Q02509 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
OC90Q02509 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
OC90Q02509 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
OC90Q02509 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
OC90Q02509 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
OC90Q02509 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
OC90Q02509 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
OC90Q02509 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
OC90Q02509 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
OC90Q02509 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
OC90Q02509 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
OC90Q02509 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
OC90Q02509 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
OC90Q02509 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
OC90Q02509 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
OC90Q02509 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
OC90Q02509 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
OC90Q02509 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
OC90Q02509 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
OC90Q02509 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
OC90Q02509 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
OC90Q02509 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
OC90Q02509 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
OC90Q02509 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
OC90Q02509 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms