Protein–RNA interactions for Protein: Q02487

DSC2, Desmocollin-2, humanhuman

Predictions only

Length 901 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSC2Q02487 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DSC2Q02487 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DSC2Q02487 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DSC2Q02487 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
DSC2Q02487 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DSC2Q02487 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DSC2Q02487 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DSC2Q02487 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
DSC2Q02487 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
DSC2Q02487 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
DSC2Q02487 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
DSC2Q02487 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
DSC2Q02487 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DSC2Q02487 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
DSC2Q02487 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
DSC2Q02487 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
DSC2Q02487 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
DSC2Q02487 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DSC2Q02487 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DSC2Q02487 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DSC2Q02487 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DSC2Q02487 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
DSC2Q02487 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
DSC2Q02487 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
DSC2Q02487 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DSC2Q02487 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
DSC2Q02487 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
DSC2Q02487 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DSC2Q02487 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
DSC2Q02487 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DSC2Q02487 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DSC2Q02487 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
DSC2Q02487 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
DSC2Q02487 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
DSC2Q02487 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DSC2Q02487 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DSC2Q02487 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
DSC2Q02487 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DSC2Q02487 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
DSC2Q02487 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
DSC2Q02487 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
DSC2Q02487 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DSC2Q02487 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
DSC2Q02487 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
DSC2Q02487 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DSC2Q02487 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DSC2Q02487 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DSC2Q02487 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
DSC2Q02487 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DSC2Q02487 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
DSC2Q02487 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
DSC2Q02487 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
DSC2Q02487 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
DSC2Q02487 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
DSC2Q02487 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
DSC2Q02487 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
DSC2Q02487 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
DSC2Q02487 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DSC2Q02487 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
DSC2Q02487 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DSC2Q02487 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DSC2Q02487 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
DSC2Q02487 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DSC2Q02487 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
DSC2Q02487 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
DSC2Q02487 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DSC2Q02487 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
DSC2Q02487 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DSC2Q02487 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DSC2Q02487 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DSC2Q02487 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DSC2Q02487 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
DSC2Q02487 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DSC2Q02487 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
DSC2Q02487 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DSC2Q02487 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DSC2Q02487 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DSC2Q02487 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DSC2Q02487 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
DSC2Q02487 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
DSC2Q02487 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
DSC2Q02487 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
DSC2Q02487 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
DSC2Q02487 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DSC2Q02487 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
DSC2Q02487 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
DSC2Q02487 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
DSC2Q02487 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
DSC2Q02487 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
DSC2Q02487 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
DSC2Q02487 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DSC2Q02487 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DSC2Q02487 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
DSC2Q02487 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
DSC2Q02487 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DSC2Q02487 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DSC2Q02487 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DSC2Q02487 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
DSC2Q02487 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DSC2Q02487 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms