Protein–RNA interactions for Protein: P48645

NMU, Neuromedin-U, humanhuman

Predictions only

Length 174 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NMUP48645 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
NMUP48645 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
NMUP48645 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
NMUP48645 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC11.6□□□□□ -0.55
NMUP48645 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
NMUP48645 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
NMUP48645 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
NMUP48645 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
NMUP48645 DNAJC13-201ENST00000260818 7730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
NMUP48645 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
NMUP48645 ATG14-201ENST00000247178 4742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
NMUP48645 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
NMUP48645 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
NMUP48645 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
NMUP48645 ALDH4A1-206ENST00000538839 2957 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
NMUP48645 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
NMUP48645 NRIP3-201ENST00000309166 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
NMUP48645 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
NMUP48645 DBR1-201ENST00000260803 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
NMUP48645 TMEM184B-202ENST00000361906 3611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
NMUP48645 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
NMUP48645 AGBL3-202ENST00000435976 2495 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
NMUP48645 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
NMUP48645 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
NMUP48645 SLC4A11-202ENST00000380059 3229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
NMUP48645 SLC4A5-205ENST00000394019 6348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
NMUP48645 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
NMUP48645 TACR2-201ENST00000373306 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
NMUP48645 NBEA-204ENST00000400445 11119 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
NMUP48645 PSMC1-201ENST00000261303 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
NMUP48645 NEDD4L-238ENST00000635997 4402 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
NMUP48645 MARK4-201ENST00000262891 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
NMUP48645 NSD2-204ENST00000382891 7534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
NMUP48645 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
NMUP48645 RET-205ENST00000615310 4337 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
NMUP48645 COL6A1-201ENST00000361866 4238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
NMUP48645 ZMYM3-204ENST00000373982 1867 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
NMUP48645 DMPK-219ENST00000600757 3357 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
NMUP48645 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
NMUP48645 GNL1-201ENST00000376621 7490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
NMUP48645 SPAST-201ENST00000315285 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
NMUP48645 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
NMUP48645 BBS2-201ENST00000245157 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
NMUP48645 ADGRG6-204ENST00000367609 6887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
NMUP48645 PRSS30P-201ENST00000390681 2881 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
NMUP48645 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
NMUP48645 PHYHD1-203ENST00000372592 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
NMUP48645 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
NMUP48645 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
NMUP48645 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
NMUP48645 SLC4A7-214ENST00000455077 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
NMUP48645 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
NMUP48645 RPS6KA4-202ENST00000528057 3121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
NMUP48645 FAM219A-203ENST00000379080 3591 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
NMUP48645 PCDHA7-201ENST00000356878 2922 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
NMUP48645 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
NMUP48645 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
NMUP48645 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
NMUP48645 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
NMUP48645 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
NMUP48645 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
NMUP48645 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
NMUP48645 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
NMUP48645 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
NMUP48645 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
NMUP48645 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
NMUP48645 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
NMUP48645 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
NMUP48645 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC11.59□□□□□ -0.55
NMUP48645 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
NMUP48645 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
NMUP48645 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
NMUP48645 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
NMUP48645 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
NMUP48645 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
NMUP48645 PODN-207ENST00000618387 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
NMUP48645 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
NMUP48645 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
NMUP48645 DDX50-206ENST00000610822 2510 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
NMUP48645 EPHB1-201ENST00000398015 4672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
NMUP48645 SLC1A7-206ENST00000620347 2873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
NMUP48645 ARHGAP31-201ENST00000264245 9317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
NMUP48645 THBS4-201ENST00000350881 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
NMUP48645 PBXIP1-202ENST00000368463 3212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
NMUP48645 TCF3-201ENST00000262965 4451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
NMUP48645 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
NMUP48645 BAG2-201ENST00000370693 6651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
NMUP48645 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
NMUP48645 C1R-201ENST00000535233 2211 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
NMUP48645 RAB11FIP1-202ENST00000330843 7811 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
NMUP48645 MUC1-223ENST00000611571 4170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
NMUP48645 ALPK3-201ENST00000258888 10917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
NMUP48645 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
NMUP48645 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
NMUP48645 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
NMUP48645 DNER-201ENST00000341772 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
NMUP48645 FLNC-202ENST00000346177 9042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
NMUP48645 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
NMUP48645 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
NMUP48645 NEK4-201ENST00000233027 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms