Protein–RNA interactions for Protein: P18031

PTPN1, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN1P18031 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PTPN1P18031 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PTPN1P18031 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PTPN1P18031 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PTPN1P18031 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PTPN1P18031 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PTPN1P18031 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PTPN1P18031 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PTPN1P18031 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PTPN1P18031 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PTPN1P18031 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PTPN1P18031 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PTPN1P18031 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PTPN1P18031 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PTPN1P18031 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PTPN1P18031 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PTPN1P18031 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PTPN1P18031 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PTPN1P18031 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PTPN1P18031 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PTPN1P18031 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
PTPN1P18031 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PTPN1P18031 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PTPN1P18031 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PTPN1P18031 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PTPN1P18031 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PTPN1P18031 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PTPN1P18031 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PTPN1P18031 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PTPN1P18031 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PTPN1P18031 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PTPN1P18031 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PTPN1P18031 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
PTPN1P18031 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PTPN1P18031 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PTPN1P18031 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PTPN1P18031 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PTPN1P18031 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PTPN1P18031 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PTPN1P18031 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
PTPN1P18031 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
PTPN1P18031 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
PTPN1P18031 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
PTPN1P18031 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
PTPN1P18031 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
PTPN1P18031 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
PTPN1P18031 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
PTPN1P18031 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
PTPN1P18031 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
PTPN1P18031 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
PTPN1P18031 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
PTPN1P18031 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
PTPN1P18031 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
PTPN1P18031 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PTPN1P18031 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PTPN1P18031 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PTPN1P18031 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PTPN1P18031 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PTPN1P18031 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PTPN1P18031 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PTPN1P18031 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PTPN1P18031 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PTPN1P18031 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PTPN1P18031 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
PTPN1P18031 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PTPN1P18031 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PTPN1P18031 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PTPN1P18031 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PTPN1P18031 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PTPN1P18031 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PTPN1P18031 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PTPN1P18031 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
PTPN1P18031 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PTPN1P18031 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PTPN1P18031 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PTPN1P18031 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PTPN1P18031 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PTPN1P18031 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PTPN1P18031 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PTPN1P18031 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PTPN1P18031 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PTPN1P18031 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PTPN1P18031 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PTPN1P18031 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PTPN1P18031 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PTPN1P18031 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PTPN1P18031 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PTPN1P18031 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PTPN1P18031 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PTPN1P18031 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PTPN1P18031 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PTPN1P18031 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PTPN1P18031 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PTPN1P18031 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PTPN1P18031 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PTPN1P18031 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PTPN1P18031 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PTPN1P18031 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PTPN1P18031 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
PTPN1P18031 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms