Protein–RNA interactions for Protein: P16615

ATP2A2, Sarcoplasmic/endoplasmic reticulum calcium ATPase 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,042 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2A2P16615 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ATP2A2P16615 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ATP2A2P16615 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ATP2A2P16615 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ATP2A2P16615 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ATP2A2P16615 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ATP2A2P16615 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ATP2A2P16615 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ATP2A2P16615 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ATP2A2P16615 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ATP2A2P16615 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ATP2A2P16615 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ATP2A2P16615 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ATP2A2P16615 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
ATP2A2P16615 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ATP2A2P16615 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ATP2A2P16615 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
ATP2A2P16615 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ATP2A2P16615 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ATP2A2P16615 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ATP2A2P16615 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ATP2A2P16615 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ATP2A2P16615 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ATP2A2P16615 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ATP2A2P16615 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ATP2A2P16615 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
ATP2A2P16615 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ATP2A2P16615 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ATP2A2P16615 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ATP2A2P16615 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ATP2A2P16615 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ATP2A2P16615 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ATP2A2P16615 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ATP2A2P16615 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ATP2A2P16615 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ATP2A2P16615 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ATP2A2P16615 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ATP2A2P16615 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ATP2A2P16615 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ATP2A2P16615 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ATP2A2P16615 IQCF3-202ENST00000440739 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ATP2A2P16615 Z94721.1-201ENST00000444102 385 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ATP2A2P16615 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
ATP2A2P16615 ROPN1-207ENST00000484329 566 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ATP2A2P16615 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ATP2A2P16615 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ATP2A2P16615 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ATP2A2P16615 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ATP2A2P16615 FAM192A-212ENST00000566077 1066 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ATP2A2P16615 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ATP2A2P16615 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ATP2A2P16615 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ATP2A2P16615 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ATP2A2P16615 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ATP2A2P16615 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ATP2A2P16615 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ATP2A2P16615 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
ATP2A2P16615 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ATP2A2P16615 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ATP2A2P16615 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ATP2A2P16615 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATP2A2P16615 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATP2A2P16615 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATP2A2P16615 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATP2A2P16615 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATP2A2P16615 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATP2A2P16615 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATP2A2P16615 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATP2A2P16615 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATP2A2P16615 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATP2A2P16615 VAMP4-202ENST00000367740 1193 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATP2A2P16615 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATP2A2P16615 PRAF2-201ENST00000376386 801 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATP2A2P16615 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATP2A2P16615 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATP2A2P16615 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATP2A2P16615 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATP2A2P16615 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
ATP2A2P16615 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATP2A2P16615 IL32-232ENST00000552356 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATP2A2P16615 AL512343.1-201ENST00000605837 169 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
ATP2A2P16615 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATP2A2P16615 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATP2A2P16615 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATP2A2P16615 SLC18A1-203ENST00000381608 1419 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATP2A2P16615 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATP2A2P16615 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATP2A2P16615 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATP2A2P16615 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATP2A2P16615 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATP2A2P16615 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATP2A2P16615 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATP2A2P16615 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATP2A2P16615 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATP2A2P16615 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATP2A2P16615 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATP2A2P16615 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATP2A2P16615 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATP2A2P16615 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATP2A2P16615 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms