Protein–RNA interactions for Protein: P07954

FH, Fumarate hydratase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 510 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FHP07954 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FHP07954 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FHP07954 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FHP07954 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FHP07954 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FHP07954 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FHP07954 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FHP07954 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FHP07954 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FHP07954 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FHP07954 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FHP07954 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FHP07954 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FHP07954 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FHP07954 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FHP07954 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FHP07954 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FHP07954 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FHP07954 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FHP07954 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FHP07954 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FHP07954 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FHP07954 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FHP07954 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FHP07954 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FHP07954 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FHP07954 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FHP07954 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FHP07954 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FHP07954 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FHP07954 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FHP07954 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FHP07954 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FHP07954 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FHP07954 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FHP07954 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FHP07954 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FHP07954 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FHP07954 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FHP07954 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FHP07954 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FHP07954 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FHP07954 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FHP07954 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FHP07954 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FHP07954 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FHP07954 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FHP07954 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FHP07954 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FHP07954 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FHP07954 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FHP07954 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FHP07954 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
FHP07954 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FHP07954 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FHP07954 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FHP07954 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FHP07954 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FHP07954 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FHP07954 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
FHP07954 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FHP07954 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
FHP07954 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FHP07954 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FHP07954 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
FHP07954 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FHP07954 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FHP07954 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FHP07954 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FHP07954 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FHP07954 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FHP07954 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FHP07954 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FHP07954 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FHP07954 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FHP07954 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FHP07954 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FHP07954 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FHP07954 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FHP07954 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FHP07954 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FHP07954 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FHP07954 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FHP07954 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FHP07954 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FHP07954 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FHP07954 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FHP07954 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FHP07954 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FHP07954 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FHP07954 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FHP07954 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FHP07954 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FHP07954 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FHP07954 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FHP07954 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FHP07954 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
FHP07954 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FHP07954 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FHP07954 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms