Protein–RNA interactions for Protein: P02549

SPTA1, Spectrin alpha chain, erythrocytic 1, humanhuman

Predictions only

Length 2,419 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTA1P02549 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SPTA1P02549 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SPTA1P02549 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SPTA1P02549 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SPTA1P02549 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SPTA1P02549 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SPTA1P02549 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SPTA1P02549 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SPTA1P02549 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SPTA1P02549 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SPTA1P02549 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SPTA1P02549 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SPTA1P02549 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SPTA1P02549 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SPTA1P02549 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SPTA1P02549 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SPTA1P02549 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SPTA1P02549 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SPTA1P02549 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SPTA1P02549 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SPTA1P02549 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SPTA1P02549 ACTG1P17-201ENST00000558391 1119 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
SPTA1P02549 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SPTA1P02549 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SPTA1P02549 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SPTA1P02549 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SPTA1P02549 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SPTA1P02549 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SPTA1P02549 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
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SPTA1P02549 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
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SPTA1P02549 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SPTA1P02549 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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SPTA1P02549 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
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SPTA1P02549 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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SPTA1P02549 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
SPTA1P02549 PQBP1-207ENST00000447146 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
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SPTA1P02549 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
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SPTA1P02549 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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SPTA1P02549 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SPTA1P02549 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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SPTA1P02549 MUC1-218ENST00000471283 635 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SPTA1P02549 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SPTA1P02549 AC090099.4-201ENST00000527671 1027 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SPTA1P02549 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SPTA1P02549 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
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SPTA1P02549 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
SPTA1P02549 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SPTA1P02549 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SPTA1P02549 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SPTA1P02549 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SPTA1P02549 MRFAP1-202ENST00000382581 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SPTA1P02549 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SPTA1P02549 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SPTA1P02549 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SPTA1P02549 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SPTA1P02549 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SPTA1P02549 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SPTA1P02549 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SPTA1P02549 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SPTA1P02549 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SPTA1P02549 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SPTA1P02549 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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