Protein–RNA interactions for Protein: O43497

CACNA1G, Voltage-dependent T-type calcium channel subunit alpha-1G, humanhuman

Predictions only

Length 2,377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1GO43497 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CACNA1GO43497 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
CACNA1GO43497 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC15□□□□□ -0.01
CACNA1GO43497 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CACNA1GO43497 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CACNA1GO43497 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CACNA1GO43497 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CACNA1GO43497 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CACNA1GO43497 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
CACNA1GO43497 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CACNA1GO43497 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CACNA1GO43497 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CACNA1GO43497 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CACNA1GO43497 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CACNA1GO43497 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CACNA1GO43497 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CACNA1GO43497 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CACNA1GO43497 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CACNA1GO43497 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CACNA1GO43497 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CACNA1GO43497 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CACNA1GO43497 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CACNA1GO43497 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CACNA1GO43497 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CACNA1GO43497 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CACNA1GO43497 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CACNA1GO43497 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CACNA1GO43497 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CACNA1GO43497 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CACNA1GO43497 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CACNA1GO43497 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CACNA1GO43497 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CACNA1GO43497 AL139420.1-201ENST00000439394 653 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CACNA1GO43497 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CACNA1GO43497 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CACNA1GO43497 CFL1-214ENST00000534769 758 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CACNA1GO43497 TNNT1-203ENST00000536926 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CACNA1GO43497 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
CACNA1GO43497 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CACNA1GO43497 SAXO2-207ENST00000566861 404 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CACNA1GO43497 CCDC144NL-AS1-209ENST00000577860 884 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CACNA1GO43497 AC011479.1-202ENST00000591889 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CACNA1GO43497 AC132192.2-201ENST00000596206 1147 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
CACNA1GO43497 DYRK1B-208ENST00000601972 772 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CACNA1GO43497 AL353622.2-201ENST00000605846 425 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
CACNA1GO43497 AC079336.7-201ENST00000623428 1078 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
CACNA1GO43497 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
CACNA1GO43497 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CACNA1GO43497 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CACNA1GO43497 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CACNA1GO43497 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CACNA1GO43497 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CACNA1GO43497 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CACNA1GO43497 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CACNA1GO43497 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CACNA1GO43497 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CACNA1GO43497 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CACNA1GO43497 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CACNA1GO43497 CYP51A1P3-201ENST00000400072 1428 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
CACNA1GO43497 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CACNA1GO43497 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CACNA1GO43497 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CACNA1GO43497 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CACNA1GO43497 AP000356.1-201ENST00000438893 364 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CACNA1GO43497 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CACNA1GO43497 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
CACNA1GO43497 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
CACNA1GO43497 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CACNA1GO43497 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CACNA1GO43497 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CACNA1GO43497 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CACNA1GO43497 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CACNA1GO43497 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CACNA1GO43497 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CACNA1GO43497 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CACNA1GO43497 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CACNA1GO43497 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CACNA1GO43497 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CACNA1GO43497 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CACNA1GO43497 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CACNA1GO43497 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CACNA1GO43497 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CACNA1GO43497 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CACNA1GO43497 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CACNA1GO43497 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CACNA1GO43497 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CACNA1GO43497 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CACNA1GO43497 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CACNA1GO43497 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CACNA1GO43497 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CACNA1GO43497 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CACNA1GO43497 CLIC1-206ENST00000375779 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CACNA1GO43497 DKFZp779M0652-201ENST00000378779 649 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CACNA1GO43497 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CACNA1GO43497 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CACNA1GO43497 UEVLD-212ENST00000541984 755 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CACNA1GO43497 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CACNA1GO43497 AC120498.1-201ENST00000563593 476 ntTSL 4 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CACNA1GO43497 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CACNA1GO43497 AC009950.1-210ENST00000594622 553 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.9 ms