Protein–RNA interactions for Protein: J3QRK9

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
J3QRK9 MEFV-201ENST00000219596 3499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
J3QRK9 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
J3QRK9 CCNJ-201ENST00000265992 4115 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
J3QRK9 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
J3QRK9 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
J3QRK9 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
J3QRK9 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
J3QRK9 CAVIN1-201ENST00000357037 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
J3QRK9 GTF2I-212ENST00000573035 4548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
J3QRK9 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
J3QRK9 ZNF202-206ENST00000529691 3384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
J3QRK9 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
J3QRK9 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
J3QRK9 DDX20-201ENST00000369702 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
J3QRK9 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
J3QRK9 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
J3QRK9 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
J3QRK9 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
J3QRK9 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
J3QRK9 FUK-201ENST00000288078 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
J3QRK9 PPL-201ENST00000345988 6238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
J3QRK9 DNASE1L1-206ENST00000393638 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
J3QRK9 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
J3QRK9 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
J3QRK9 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
J3QRK9 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
J3QRK9 WLS-201ENST00000262348 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
J3QRK9 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
J3QRK9 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
J3QRK9 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
J3QRK9 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
J3QRK9 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
J3QRK9 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
J3QRK9 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
J3QRK9 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
J3QRK9 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
J3QRK9 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
J3QRK9 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
J3QRK9 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
J3QRK9 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
J3QRK9 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
J3QRK9 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
J3QRK9 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
J3QRK9 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
J3QRK9 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
J3QRK9 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
J3QRK9 KIF6-203ENST00000394362 2394 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
J3QRK9 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
J3QRK9 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
J3QRK9 AC027601.5-201ENST00000624065 2482 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
J3QRK9 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
J3QRK9 PPP6R2-204ENST00000395744 3293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
J3QRK9 EP400NL-206ENST00000446190 3697 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
J3QRK9 LBH-201ENST00000395323 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
J3QRK9 SCUBE2-201ENST00000309263 3727 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
J3QRK9 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
J3QRK9 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
J3QRK9 CCT3-201ENST00000295688 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
J3QRK9 CYB561-201ENST00000360793 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
J3QRK9 ITPK1-207ENST00000555495 3035 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
J3QRK9 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
J3QRK9 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
J3QRK9 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
J3QRK9 GAK-201ENST00000314167 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
J3QRK9 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
J3QRK9 APP-205ENST00000358918 2366 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
J3QRK9 ATP13A2-202ENST00000341676 3681 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
J3QRK9 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
J3QRK9 APLP2-203ENST00000338167 3270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
J3QRK9 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
J3QRK9 ALDOA-203ENST00000395248 2447 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
J3QRK9 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
J3QRK9 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
J3QRK9 SGK2-201ENST00000341458 2498 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
J3QRK9 ARPC4-TTLL3-201ENST00000397256 2466 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
J3QRK9 ALDH3A2-226ENST00000631291 3822 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
J3QRK9 SYN2-205ENST00000620175 3871 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
J3QRK9 OXTR-201ENST00000316793 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
J3QRK9 BCAN-201ENST00000329117 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
J3QRK9 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
J3QRK9 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
J3QRK9 UBE2D4-201ENST00000222402 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
J3QRK9 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
J3QRK9 CUL7-203ENST00000535468 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
J3QRK9 ISLR-202ENST00000395118 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
J3QRK9 GLG1-203ENST00000447066 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
J3QRK9 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
J3QRK9 DNER-201ENST00000341772 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
J3QRK9 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
J3QRK9 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
J3QRK9 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
J3QRK9 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
J3QRK9 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
J3QRK9 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
J3QRK9 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
J3QRK9 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
J3QRK9 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
J3QRK9 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC14.56□□□□□ -0.08
J3QRK9 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
J3QRK9 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms