Protein–RNA interactions for Protein: E9PBE3

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E9PBE3 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
E9PBE3 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
E9PBE3 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
E9PBE3 POLL-206ENST00000370172 2308 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
E9PBE3 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
E9PBE3 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
E9PBE3 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
E9PBE3 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
E9PBE3 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
E9PBE3 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
E9PBE3 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
E9PBE3 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
E9PBE3 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
E9PBE3 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
E9PBE3 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
E9PBE3 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
E9PBE3 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
E9PBE3 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
E9PBE3 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
E9PBE3 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
E9PBE3 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
E9PBE3 AC021683.3-202ENST00000592572 4440 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
E9PBE3 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
E9PBE3 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
E9PBE3 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
E9PBE3 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
E9PBE3 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
E9PBE3 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
E9PBE3 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
E9PBE3 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
E9PBE3 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
E9PBE3 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
E9PBE3 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
E9PBE3 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
E9PBE3 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
E9PBE3 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
E9PBE3 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
E9PBE3 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
E9PBE3 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
E9PBE3 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
E9PBE3 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
E9PBE3 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
E9PBE3 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
E9PBE3 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
E9PBE3 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
E9PBE3 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
E9PBE3 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
E9PBE3 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
E9PBE3 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
E9PBE3 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
E9PBE3 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
E9PBE3 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
E9PBE3 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
E9PBE3 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
E9PBE3 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
E9PBE3 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
E9PBE3 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
E9PBE3 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
E9PBE3 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
E9PBE3 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
E9PBE3 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
E9PBE3 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
E9PBE3 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
E9PBE3 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
E9PBE3 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
E9PBE3 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
E9PBE3 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
E9PBE3 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
E9PBE3 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
E9PBE3 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
E9PBE3 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
E9PBE3 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
E9PBE3 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
E9PBE3 AAK1-202ENST00000409068 2606 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
E9PBE3 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
E9PBE3 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
E9PBE3 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
E9PBE3 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
E9PBE3 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
E9PBE3 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
E9PBE3 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
E9PBE3 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
E9PBE3 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
E9PBE3 MIRLET7BHG-203ENST00000435439 2264 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
E9PBE3 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
E9PBE3 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
E9PBE3 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
E9PBE3 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
E9PBE3 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
E9PBE3 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
E9PBE3 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
E9PBE3 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
E9PBE3 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
E9PBE3 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
E9PBE3 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
E9PBE3 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
E9PBE3 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
E9PBE3 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
E9PBE3 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
E9PBE3 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.9 ms