Protein–RNA interactions for Protein: Q9UFW8

CGGBP1, CGG triplet repeat-binding protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 167 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CGGBP1Q9UFW8 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
CGGBP1Q9UFW8 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
CGGBP1Q9UFW8 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
CGGBP1Q9UFW8 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
CGGBP1Q9UFW8 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
CGGBP1Q9UFW8 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
CGGBP1Q9UFW8 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
CGGBP1Q9UFW8 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
CGGBP1Q9UFW8 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
CGGBP1Q9UFW8 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
CGGBP1Q9UFW8 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
CGGBP1Q9UFW8 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
CGGBP1Q9UFW8 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
CGGBP1Q9UFW8 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
CGGBP1Q9UFW8 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
CGGBP1Q9UFW8 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
CGGBP1Q9UFW8 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
CGGBP1Q9UFW8 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
CGGBP1Q9UFW8 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
CGGBP1Q9UFW8 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
CGGBP1Q9UFW8 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
CGGBP1Q9UFW8 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
CGGBP1Q9UFW8 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
CGGBP1Q9UFW8 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
CGGBP1Q9UFW8 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
CGGBP1Q9UFW8 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
CGGBP1Q9UFW8 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
CGGBP1Q9UFW8 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.35□□□□□ -0.11
CGGBP1Q9UFW8 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
CGGBP1Q9UFW8 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
CGGBP1Q9UFW8 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
CGGBP1Q9UFW8 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
CGGBP1Q9UFW8 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
CGGBP1Q9UFW8 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC14.35□□□□□ -0.11
CGGBP1Q9UFW8 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
CGGBP1Q9UFW8 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
CGGBP1Q9UFW8 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
CGGBP1Q9UFW8 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
CGGBP1Q9UFW8 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC14.35□□□□□ -0.11
CGGBP1Q9UFW8 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
CGGBP1Q9UFW8 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
CGGBP1Q9UFW8 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
CGGBP1Q9UFW8 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
CGGBP1Q9UFW8 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
CGGBP1Q9UFW8 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
CGGBP1Q9UFW8 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
CGGBP1Q9UFW8 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
CGGBP1Q9UFW8 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
CGGBP1Q9UFW8 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
CGGBP1Q9UFW8 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
CGGBP1Q9UFW8 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
CGGBP1Q9UFW8 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
CGGBP1Q9UFW8 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
CGGBP1Q9UFW8 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
CGGBP1Q9UFW8 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
CGGBP1Q9UFW8 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
CGGBP1Q9UFW8 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
CGGBP1Q9UFW8 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
CGGBP1Q9UFW8 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
CGGBP1Q9UFW8 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
CGGBP1Q9UFW8 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
CGGBP1Q9UFW8 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
CGGBP1Q9UFW8 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
CGGBP1Q9UFW8 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
CGGBP1Q9UFW8 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
CGGBP1Q9UFW8 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
CGGBP1Q9UFW8 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
CGGBP1Q9UFW8 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
CGGBP1Q9UFW8 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
CGGBP1Q9UFW8 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
CGGBP1Q9UFW8 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
CGGBP1Q9UFW8 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
CGGBP1Q9UFW8 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
CGGBP1Q9UFW8 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
CGGBP1Q9UFW8 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
CGGBP1Q9UFW8 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
CGGBP1Q9UFW8 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
CGGBP1Q9UFW8 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
CGGBP1Q9UFW8 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
CGGBP1Q9UFW8 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
CGGBP1Q9UFW8 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
CGGBP1Q9UFW8 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
CGGBP1Q9UFW8 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
CGGBP1Q9UFW8 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
CGGBP1Q9UFW8 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
CGGBP1Q9UFW8 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
CGGBP1Q9UFW8 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
CGGBP1Q9UFW8 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
CGGBP1Q9UFW8 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
CGGBP1Q9UFW8 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
CGGBP1Q9UFW8 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
CGGBP1Q9UFW8 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
CGGBP1Q9UFW8 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
CGGBP1Q9UFW8 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
CGGBP1Q9UFW8 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
CGGBP1Q9UFW8 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
CGGBP1Q9UFW8 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
CGGBP1Q9UFW8 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
CGGBP1Q9UFW8 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
CGGBP1Q9UFW8 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.11
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