Protein–RNA interactions for Protein: Q9NWF4

SLC52A1, Solute carrier family 52, riboflavin transporter, member 1, humanhuman

Predictions only

Length 448 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC52A1Q9NWF4 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC52A1Q9NWF4 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC52A1Q9NWF4 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC52A1Q9NWF4 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC52A1Q9NWF4 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC52A1Q9NWF4 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC52A1Q9NWF4 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC52A1Q9NWF4 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC52A1Q9NWF4 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC52A1Q9NWF4 LINC01665-201ENST00000422917 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC52A1Q9NWF4 C1QTNF6-203ENST00000434784 975 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC52A1Q9NWF4 AL162742.1-201ENST00000434792 954 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC52A1Q9NWF4 AC011365.2-201ENST00000520041 810 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC52A1Q9NWF4 UEVLD-212ENST00000541984 755 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC52A1Q9NWF4 AL133523.1-201ENST00000554537 331 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC52A1Q9NWF4 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC52A1Q9NWF4 EGLN2-209ENST00000594140 991 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC52A1Q9NWF4 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC52A1Q9NWF4 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC52A1Q9NWF4 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC52A1Q9NWF4 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC52A1Q9NWF4 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC52A1Q9NWF4 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC52A1Q9NWF4 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC52A1Q9NWF4 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC52A1Q9NWF4 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC52A1Q9NWF4 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC52A1Q9NWF4 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC52A1Q9NWF4 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC52A1Q9NWF4 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC52A1Q9NWF4 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC52A1Q9NWF4 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC52A1Q9NWF4 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC52A1Q9NWF4 RGS6-218ENST00000556437 1689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC52A1Q9NWF4 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC52A1Q9NWF4 PRDX5-203ENST00000352435 596 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC52A1Q9NWF4 AHRR-211ENST00000515206 462 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC52A1Q9NWF4 TMEM219-203ENST00000561899 1249 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC52A1Q9NWF4 AL031600.1-201ENST00000563610 570 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC52A1Q9NWF4 AP002360.2-202ENST00000572035 738 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC52A1Q9NWF4 TSR1-204ENST00000576112 1290 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC52A1Q9NWF4 COPS9-205ENST00000607357 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC52A1Q9NWF4 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC52A1Q9NWF4 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC52A1Q9NWF4 PGBD5-202ENST00000525115 1569 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC52A1Q9NWF4 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC52A1Q9NWF4 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC52A1Q9NWF4 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC52A1Q9NWF4 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC52A1Q9NWF4 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC52A1Q9NWF4 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC52A1Q9NWF4 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC52A1Q9NWF4 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC52A1Q9NWF4 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC52A1Q9NWF4 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC52A1Q9NWF4 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC52A1Q9NWF4 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC52A1Q9NWF4 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC52A1Q9NWF4 NPPC-201ENST00000295440 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC52A1Q9NWF4 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC52A1Q9NWF4 C3orf22-201ENST00000318225 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC52A1Q9NWF4 PPP1R14B-202ENST00000392210 600 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC52A1Q9NWF4 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC52A1Q9NWF4 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC52A1Q9NWF4 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC52A1Q9NWF4 AL049698.1-202ENST00000441716 757 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC52A1Q9NWF4 Z98752.1-201ENST00000442482 518 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC52A1Q9NWF4 CENPM-208ENST00000472374 541 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC52A1Q9NWF4 RAB40B-202ENST00000538809 704 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC52A1Q9NWF4 AC125603.2-201ENST00000546835 876 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC52A1Q9NWF4 VASH1-AS1-201ENST00000554058 871 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC52A1Q9NWF4 AC012322.1-201ENST00000561657 861 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC52A1Q9NWF4 AC093326.2-201ENST00000640770 729 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC52A1Q9NWF4 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC52A1Q9NWF4 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC52A1Q9NWF4 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC52A1Q9NWF4 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC52A1Q9NWF4 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC52A1Q9NWF4 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC52A1Q9NWF4 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC52A1Q9NWF4 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC52A1Q9NWF4 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC52A1Q9NWF4 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC52A1Q9NWF4 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC52A1Q9NWF4 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC52A1Q9NWF4 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC52A1Q9NWF4 SNAP47-203ENST00000366760 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC52A1Q9NWF4 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC52A1Q9NWF4 COX6A2-201ENST00000287490 440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC52A1Q9NWF4 PFDN5-202ENST00000334478 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC52A1Q9NWF4 MUC1-202ENST00000338684 1107 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC52A1Q9NWF4 MIR326-201ENST00000362220 95 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC52A1Q9NWF4 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC52A1Q9NWF4 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC52A1Q9NWF4 RPL13A-201ENST00000391857 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC52A1Q9NWF4 U82695.1-202ENST00000428676 700 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC52A1Q9NWF4 MUC1-218ENST00000471283 635 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC52A1Q9NWF4 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC52A1Q9NWF4 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC52A1Q9NWF4 PLA2G4C-AS1-201ENST00000596552 568 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.7 ms