Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVI7

ATAD3A, ATPase family AAA domain-containing protein 3A, humanhuman

Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATAD3AQ9NVI7 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATAD3AQ9NVI7 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATAD3AQ9NVI7 SYAP1-201ENST00000380155 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATAD3AQ9NVI7 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATAD3AQ9NVI7 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATAD3AQ9NVI7 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATAD3AQ9NVI7 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
ATAD3AQ9NVI7 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATAD3AQ9NVI7 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATAD3AQ9NVI7 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
ATAD3AQ9NVI7 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATAD3AQ9NVI7 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATAD3AQ9NVI7 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATAD3AQ9NVI7 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATAD3AQ9NVI7 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATAD3AQ9NVI7 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATAD3AQ9NVI7 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATAD3AQ9NVI7 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATAD3AQ9NVI7 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATAD3AQ9NVI7 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATAD3AQ9NVI7 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATAD3AQ9NVI7 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATAD3AQ9NVI7 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATAD3AQ9NVI7 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATAD3AQ9NVI7 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
ATAD3AQ9NVI7 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
ATAD3AQ9NVI7 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATAD3AQ9NVI7 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
ATAD3AQ9NVI7 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATAD3AQ9NVI7 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATAD3AQ9NVI7 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATAD3AQ9NVI7 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATAD3AQ9NVI7 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATAD3AQ9NVI7 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATAD3AQ9NVI7 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATAD3AQ9NVI7 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATAD3AQ9NVI7 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATAD3AQ9NVI7 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATAD3AQ9NVI7 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATAD3AQ9NVI7 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATAD3AQ9NVI7 HSPH1-201ENST00000320027 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATAD3AQ9NVI7 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATAD3AQ9NVI7 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATAD3AQ9NVI7 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATAD3AQ9NVI7 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATAD3AQ9NVI7 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATAD3AQ9NVI7 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATAD3AQ9NVI7 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATAD3AQ9NVI7 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATAD3AQ9NVI7 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATAD3AQ9NVI7 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATAD3AQ9NVI7 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATAD3AQ9NVI7 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATAD3AQ9NVI7 ARNT2-204ENST00000527771 2458 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATAD3AQ9NVI7 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATAD3AQ9NVI7 SMARCA2-203ENST00000349721 5761 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATAD3AQ9NVI7 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATAD3AQ9NVI7 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATAD3AQ9NVI7 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATAD3AQ9NVI7 AL122018.1-201ENST00000446607 2310 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
ATAD3AQ9NVI7 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATAD3AQ9NVI7 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATAD3AQ9NVI7 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATAD3AQ9NVI7 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATAD3AQ9NVI7 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
ATAD3AQ9NVI7 CYB561D1-204ENST00000420578 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATAD3AQ9NVI7 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATAD3AQ9NVI7 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATAD3AQ9NVI7 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATAD3AQ9NVI7 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATAD3AQ9NVI7 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATAD3AQ9NVI7 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATAD3AQ9NVI7 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATAD3AQ9NVI7 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATAD3AQ9NVI7 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATAD3AQ9NVI7 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
ATAD3AQ9NVI7 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
ATAD3AQ9NVI7 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATAD3AQ9NVI7 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATAD3AQ9NVI7 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATAD3AQ9NVI7 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATAD3AQ9NVI7 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATAD3AQ9NVI7 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATAD3AQ9NVI7 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATAD3AQ9NVI7 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATAD3AQ9NVI7 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATAD3AQ9NVI7 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
ATAD3AQ9NVI7 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATAD3AQ9NVI7 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATAD3AQ9NVI7 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATAD3AQ9NVI7 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATAD3AQ9NVI7 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATAD3AQ9NVI7 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATAD3AQ9NVI7 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATAD3AQ9NVI7 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATAD3AQ9NVI7 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATAD3AQ9NVI7 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATAD3AQ9NVI7 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATAD3AQ9NVI7 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATAD3AQ9NVI7 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.4 ms