Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUN5

LMBRD1, Probable lysosomal cobalamin transporter, humanhuman

Predictions only

Length 540 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMBRD1Q9NUN5 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
LMBRD1Q9NUN5 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
LMBRD1Q9NUN5 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
LMBRD1Q9NUN5 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
LMBRD1Q9NUN5 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
LMBRD1Q9NUN5 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
LMBRD1Q9NUN5 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
LMBRD1Q9NUN5 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
LMBRD1Q9NUN5 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
LMBRD1Q9NUN5 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
LMBRD1Q9NUN5 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
LMBRD1Q9NUN5 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
LMBRD1Q9NUN5 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
LMBRD1Q9NUN5 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
LMBRD1Q9NUN5 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
LMBRD1Q9NUN5 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
LMBRD1Q9NUN5 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
LMBRD1Q9NUN5 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
LMBRD1Q9NUN5 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
LMBRD1Q9NUN5 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
LMBRD1Q9NUN5 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
LMBRD1Q9NUN5 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
LMBRD1Q9NUN5 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
LMBRD1Q9NUN5 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
LMBRD1Q9NUN5 CA10-201ENST00000285273 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
LMBRD1Q9NUN5 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
LMBRD1Q9NUN5 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
LMBRD1Q9NUN5 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
LMBRD1Q9NUN5 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
LMBRD1Q9NUN5 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
LMBRD1Q9NUN5 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
LMBRD1Q9NUN5 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
LMBRD1Q9NUN5 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
LMBRD1Q9NUN5 ATP5F1-202ENST00000369722 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
LMBRD1Q9NUN5 POLR2B-205ENST00000441246 3839 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
LMBRD1Q9NUN5 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
LMBRD1Q9NUN5 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
LMBRD1Q9NUN5 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
LMBRD1Q9NUN5 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
LMBRD1Q9NUN5 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
LMBRD1Q9NUN5 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
LMBRD1Q9NUN5 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
LMBRD1Q9NUN5 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
LMBRD1Q9NUN5 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
LMBRD1Q9NUN5 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
LMBRD1Q9NUN5 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
LMBRD1Q9NUN5 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
LMBRD1Q9NUN5 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
LMBRD1Q9NUN5 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
LMBRD1Q9NUN5 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
LMBRD1Q9NUN5 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
LMBRD1Q9NUN5 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.59■□□□□ 0.57
LMBRD1Q9NUN5 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
LMBRD1Q9NUN5 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
LMBRD1Q9NUN5 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC18.59■□□□□ 0.57
LMBRD1Q9NUN5 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
LMBRD1Q9NUN5 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
LMBRD1Q9NUN5 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
LMBRD1Q9NUN5 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
LMBRD1Q9NUN5 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
LMBRD1Q9NUN5 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
LMBRD1Q9NUN5 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
LMBRD1Q9NUN5 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
LMBRD1Q9NUN5 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
LMBRD1Q9NUN5 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
LMBRD1Q9NUN5 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
LMBRD1Q9NUN5 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
LMBRD1Q9NUN5 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
LMBRD1Q9NUN5 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
LMBRD1Q9NUN5 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
LMBRD1Q9NUN5 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
LMBRD1Q9NUN5 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
LMBRD1Q9NUN5 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
LMBRD1Q9NUN5 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
LMBRD1Q9NUN5 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
LMBRD1Q9NUN5 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
LMBRD1Q9NUN5 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
LMBRD1Q9NUN5 PTK7-210ENST00000471863 2412 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
LMBRD1Q9NUN5 PRR23C-201ENST00000413199 2791 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
LMBRD1Q9NUN5 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
LMBRD1Q9NUN5 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
LMBRD1Q9NUN5 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
LMBRD1Q9NUN5 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
LMBRD1Q9NUN5 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
LMBRD1Q9NUN5 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
LMBRD1Q9NUN5 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
LMBRD1Q9NUN5 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
LMBRD1Q9NUN5 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
LMBRD1Q9NUN5 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
LMBRD1Q9NUN5 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
LMBRD1Q9NUN5 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
LMBRD1Q9NUN5 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
LMBRD1Q9NUN5 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
LMBRD1Q9NUN5 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
LMBRD1Q9NUN5 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
LMBRD1Q9NUN5 PKN1-202ENST00000342216 2960 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
LMBRD1Q9NUN5 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
LMBRD1Q9NUN5 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
LMBRD1Q9NUN5 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
LMBRD1Q9NUN5 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.4 ms