Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXT4

TDRD1, Tudor domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDRD1Q9BXT4 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TDRD1Q9BXT4 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
TDRD1Q9BXT4 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TDRD1Q9BXT4 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TDRD1Q9BXT4 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
TDRD1Q9BXT4 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TDRD1Q9BXT4 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TDRD1Q9BXT4 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TDRD1Q9BXT4 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TDRD1Q9BXT4 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TDRD1Q9BXT4 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TDRD1Q9BXT4 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TDRD1Q9BXT4 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TDRD1Q9BXT4 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TDRD1Q9BXT4 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TDRD1Q9BXT4 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TDRD1Q9BXT4 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TDRD1Q9BXT4 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TDRD1Q9BXT4 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TDRD1Q9BXT4 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TDRD1Q9BXT4 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TDRD1Q9BXT4 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TDRD1Q9BXT4 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TDRD1Q9BXT4 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TDRD1Q9BXT4 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TDRD1Q9BXT4 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TDRD1Q9BXT4 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TDRD1Q9BXT4 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TDRD1Q9BXT4 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TDRD1Q9BXT4 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
TDRD1Q9BXT4 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TDRD1Q9BXT4 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TDRD1Q9BXT4 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TDRD1Q9BXT4 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TDRD1Q9BXT4 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TDRD1Q9BXT4 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TDRD1Q9BXT4 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TDRD1Q9BXT4 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TDRD1Q9BXT4 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TDRD1Q9BXT4 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
TDRD1Q9BXT4 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TDRD1Q9BXT4 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TDRD1Q9BXT4 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TDRD1Q9BXT4 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TDRD1Q9BXT4 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TDRD1Q9BXT4 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TDRD1Q9BXT4 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TDRD1Q9BXT4 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TDRD1Q9BXT4 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TDRD1Q9BXT4 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TDRD1Q9BXT4 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TDRD1Q9BXT4 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TDRD1Q9BXT4 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TDRD1Q9BXT4 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TDRD1Q9BXT4 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TDRD1Q9BXT4 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TDRD1Q9BXT4 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TDRD1Q9BXT4 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TDRD1Q9BXT4 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TDRD1Q9BXT4 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TDRD1Q9BXT4 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TDRD1Q9BXT4 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TDRD1Q9BXT4 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TDRD1Q9BXT4 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TDRD1Q9BXT4 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TDRD1Q9BXT4 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TDRD1Q9BXT4 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TDRD1Q9BXT4 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TDRD1Q9BXT4 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TDRD1Q9BXT4 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
TDRD1Q9BXT4 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TDRD1Q9BXT4 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TDRD1Q9BXT4 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
TDRD1Q9BXT4 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
TDRD1Q9BXT4 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TDRD1Q9BXT4 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TDRD1Q9BXT4 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TDRD1Q9BXT4 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TDRD1Q9BXT4 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TDRD1Q9BXT4 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TDRD1Q9BXT4 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TDRD1Q9BXT4 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TDRD1Q9BXT4 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TDRD1Q9BXT4 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TDRD1Q9BXT4 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TDRD1Q9BXT4 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TDRD1Q9BXT4 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TDRD1Q9BXT4 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TDRD1Q9BXT4 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TDRD1Q9BXT4 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TDRD1Q9BXT4 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TDRD1Q9BXT4 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TDRD1Q9BXT4 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TDRD1Q9BXT4 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TDRD1Q9BXT4 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TDRD1Q9BXT4 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
TDRD1Q9BXT4 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
TDRD1Q9BXT4 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TDRD1Q9BXT4 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TDRD1Q9BXT4 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.5 ms