Protein–RNA interactions for Protein: Q99523

SORT1, Sortilin, humanhuman

Predictions only

Length 831 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SORT1Q99523 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SORT1Q99523 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SORT1Q99523 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SORT1Q99523 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
SORT1Q99523 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SORT1Q99523 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SORT1Q99523 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SORT1Q99523 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SORT1Q99523 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SORT1Q99523 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SORT1Q99523 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SORT1Q99523 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
SORT1Q99523 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SORT1Q99523 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SORT1Q99523 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SORT1Q99523 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SORT1Q99523 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SORT1Q99523 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SORT1Q99523 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SORT1Q99523 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SORT1Q99523 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SORT1Q99523 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SORT1Q99523 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SORT1Q99523 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SORT1Q99523 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SORT1Q99523 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SORT1Q99523 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SORT1Q99523 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SORT1Q99523 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SORT1Q99523 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SORT1Q99523 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SORT1Q99523 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SORT1Q99523 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SORT1Q99523 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SORT1Q99523 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SORT1Q99523 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SORT1Q99523 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SORT1Q99523 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
SORT1Q99523 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SORT1Q99523 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SORT1Q99523 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SORT1Q99523 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SORT1Q99523 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SORT1Q99523 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
SORT1Q99523 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SORT1Q99523 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
SORT1Q99523 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
SORT1Q99523 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SORT1Q99523 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
SORT1Q99523 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SORT1Q99523 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SORT1Q99523 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SORT1Q99523 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SORT1Q99523 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SORT1Q99523 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SORT1Q99523 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SORT1Q99523 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SORT1Q99523 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SORT1Q99523 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SORT1Q99523 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SORT1Q99523 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SORT1Q99523 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SORT1Q99523 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SORT1Q99523 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SORT1Q99523 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SORT1Q99523 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SORT1Q99523 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SORT1Q99523 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SORT1Q99523 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SORT1Q99523 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SORT1Q99523 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SORT1Q99523 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SORT1Q99523 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SORT1Q99523 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SORT1Q99523 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SORT1Q99523 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SORT1Q99523 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SORT1Q99523 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SORT1Q99523 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SORT1Q99523 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SORT1Q99523 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SORT1Q99523 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SORT1Q99523 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SORT1Q99523 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SORT1Q99523 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SORT1Q99523 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SORT1Q99523 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SORT1Q99523 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SORT1Q99523 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SORT1Q99523 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SORT1Q99523 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SORT1Q99523 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SORT1Q99523 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SORT1Q99523 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SORT1Q99523 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SORT1Q99523 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SORT1Q99523 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SORT1Q99523 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SORT1Q99523 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SORT1Q99523 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 94.4 ms