Protein–RNA interactions for Protein: Q96LR9

APOLD1, Apolipoprotein L domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 279 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOLD1Q96LR9 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
APOLD1Q96LR9 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
APOLD1Q96LR9 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
APOLD1Q96LR9 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
APOLD1Q96LR9 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
APOLD1Q96LR9 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
APOLD1Q96LR9 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
APOLD1Q96LR9 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
APOLD1Q96LR9 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
APOLD1Q96LR9 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
APOLD1Q96LR9 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
APOLD1Q96LR9 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
APOLD1Q96LR9 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
APOLD1Q96LR9 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
APOLD1Q96LR9 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
APOLD1Q96LR9 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
APOLD1Q96LR9 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
APOLD1Q96LR9 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
APOLD1Q96LR9 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
APOLD1Q96LR9 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
APOLD1Q96LR9 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
APOLD1Q96LR9 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
APOLD1Q96LR9 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
APOLD1Q96LR9 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
APOLD1Q96LR9 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
APOLD1Q96LR9 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
APOLD1Q96LR9 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
APOLD1Q96LR9 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
APOLD1Q96LR9 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
APOLD1Q96LR9 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
APOLD1Q96LR9 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
APOLD1Q96LR9 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
APOLD1Q96LR9 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
APOLD1Q96LR9 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
APOLD1Q96LR9 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
APOLD1Q96LR9 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
APOLD1Q96LR9 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
APOLD1Q96LR9 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
APOLD1Q96LR9 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
APOLD1Q96LR9 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
APOLD1Q96LR9 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
APOLD1Q96LR9 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
APOLD1Q96LR9 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
APOLD1Q96LR9 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
APOLD1Q96LR9 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
APOLD1Q96LR9 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
APOLD1Q96LR9 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
APOLD1Q96LR9 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
APOLD1Q96LR9 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
APOLD1Q96LR9 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
APOLD1Q96LR9 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
APOLD1Q96LR9 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
APOLD1Q96LR9 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
APOLD1Q96LR9 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
APOLD1Q96LR9 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
APOLD1Q96LR9 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
APOLD1Q96LR9 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
APOLD1Q96LR9 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
APOLD1Q96LR9 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
APOLD1Q96LR9 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
APOLD1Q96LR9 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
APOLD1Q96LR9 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
APOLD1Q96LR9 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
APOLD1Q96LR9 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
APOLD1Q96LR9 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
APOLD1Q96LR9 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
APOLD1Q96LR9 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
APOLD1Q96LR9 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
APOLD1Q96LR9 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
APOLD1Q96LR9 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
APOLD1Q96LR9 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
APOLD1Q96LR9 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
APOLD1Q96LR9 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
APOLD1Q96LR9 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
APOLD1Q96LR9 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
APOLD1Q96LR9 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
APOLD1Q96LR9 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
APOLD1Q96LR9 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
APOLD1Q96LR9 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
APOLD1Q96LR9 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
APOLD1Q96LR9 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
APOLD1Q96LR9 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
APOLD1Q96LR9 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
APOLD1Q96LR9 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
APOLD1Q96LR9 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
APOLD1Q96LR9 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
APOLD1Q96LR9 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
APOLD1Q96LR9 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
APOLD1Q96LR9 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
APOLD1Q96LR9 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
APOLD1Q96LR9 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
APOLD1Q96LR9 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
APOLD1Q96LR9 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
APOLD1Q96LR9 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
APOLD1Q96LR9 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
APOLD1Q96LR9 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
APOLD1Q96LR9 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
APOLD1Q96LR9 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
APOLD1Q96LR9 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
APOLD1Q96LR9 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms