Protein–RNA interactions for Protein: Q96GF1

RNF185, E3 ubiquitin-protein ligase RNF185, humanhuman

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Length 192 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF185Q96GF1 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
RNF185Q96GF1 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
RNF185Q96GF1 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
RNF185Q96GF1 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
RNF185Q96GF1 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
RNF185Q96GF1 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
RNF185Q96GF1 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
RNF185Q96GF1 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
RNF185Q96GF1 POU5F1-204ENST00000471529 1723 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
RNF185Q96GF1 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
RNF185Q96GF1 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.52
RNF185Q96GF1 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.52
RNF185Q96GF1 CA10-201ENST00000285273 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
RNF185Q96GF1 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.52
RNF185Q96GF1 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.52
RNF185Q96GF1 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
RNF185Q96GF1 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
RNF185Q96GF1 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.52
RNF185Q96GF1 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
RNF185Q96GF1 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.52
RNF185Q96GF1 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.52
RNF185Q96GF1 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.52
RNF185Q96GF1 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
RNF185Q96GF1 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
RNF185Q96GF1 PRDM6-201ENST00000407847 9267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
RNF185Q96GF1 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
RNF185Q96GF1 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
RNF185Q96GF1 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
RNF185Q96GF1 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
RNF185Q96GF1 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
RNF185Q96GF1 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
RNF185Q96GF1 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
RNF185Q96GF1 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.77□□□□□ -0.53
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RNF185Q96GF1 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
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RNF185Q96GF1 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
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RNF185Q96GF1 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
RNF185Q96GF1 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
RNF185Q96GF1 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
RNF185Q96GF1 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
RNF185Q96GF1 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
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RNF185Q96GF1 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
RNF185Q96GF1 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
RNF185Q96GF1 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
RNF185Q96GF1 DIAPH2-204ENST00000373054 3376 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
RNF185Q96GF1 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
RNF185Q96GF1 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
RNF185Q96GF1 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
RNF185Q96GF1 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
RNF185Q96GF1 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
RNF185Q96GF1 BHMG1-201ENST00000457052 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
RNF185Q96GF1 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
RNF185Q96GF1 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
RNF185Q96GF1 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
RNF185Q96GF1 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
RNF185Q96GF1 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
RNF185Q96GF1 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
RNF185Q96GF1 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
RNF185Q96GF1 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.76□□□□□ -0.53
RNF185Q96GF1 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
RNF185Q96GF1 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
RNF185Q96GF1 CHFR-204ENST00000443047 2990 ntTSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
RNF185Q96GF1 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
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