Protein–RNA interactions for Protein: Q92547

TOPBP1, DNA topoisomerase 2-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOPBP1Q92547 PDHB-206ENST00000474765 1503 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
TOPBP1Q92547 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
TOPBP1Q92547 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
TOPBP1Q92547 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
TOPBP1Q92547 MAPK15-203ENST00000395108 765 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
TOPBP1Q92547 FOXP4-AS1-203ENST00000439386 404 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
TOPBP1Q92547 MSRB3-209ENST00000540804 884 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
TOPBP1Q92547 AP003419.2-201ENST00000543494 711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
TOPBP1Q92547 ZNF596-213ENST00000640035 1163 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
TOPBP1Q92547 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
TOPBP1Q92547 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
TOPBP1Q92547 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
TOPBP1Q92547 AL354989.2-201ENST00000435838 1540 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
TOPBP1Q92547 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
TOPBP1Q92547 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
TOPBP1Q92547 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
TOPBP1Q92547 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
TOPBP1Q92547 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
TOPBP1Q92547 CPA5-201ENST00000393213 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
TOPBP1Q92547 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
TOPBP1Q92547 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
TOPBP1Q92547 RPP40-201ENST00000319533 1088 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
TOPBP1Q92547 ARL16-201ENST00000397498 1227 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
TOPBP1Q92547 FGF13-204ENST00000436198 1165 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
TOPBP1Q92547 SERPINA13P-202ENST00000478994 924 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
TOPBP1Q92547 PPP1R32-205ENST00000538185 1107 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
TOPBP1Q92547 NAT9-222ENST00000583476 583 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
TOPBP1Q92547 ARL16-214ENST00000621051 1181 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
TOPBP1Q92547 LINC00969-254ENST00000625358 962 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
TOPBP1Q92547 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
TOPBP1Q92547 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TOPBP1Q92547 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TOPBP1Q92547 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TOPBP1Q92547 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TOPBP1Q92547 BMP4-206ENST00000559087 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TOPBP1Q92547 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TOPBP1Q92547 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
TOPBP1Q92547 COX4I1-201ENST00000253452 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TOPBP1Q92547 BORCS5-201ENST00000298571 549 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TOPBP1Q92547 MPV17-205ENST00000402310 906 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
TOPBP1Q92547 UCHL1-207ENST00000508768 827 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
TOPBP1Q92547 C14orf132-202ENST00000553782 536 ntTSL 4 BASIC26.48■■□□□ 1.83
TOPBP1Q92547 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TOPBP1Q92547 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TOPBP1Q92547 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TOPBP1Q92547 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TOPBP1Q92547 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
TOPBP1Q92547 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
TOPBP1Q92547 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TOPBP1Q92547 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TOPBP1Q92547 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
TOPBP1Q92547 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TOPBP1Q92547 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
TOPBP1Q92547 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
TOPBP1Q92547 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
TOPBP1Q92547 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TOPBP1Q92547 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
TOPBP1Q92547 COX10-AS1-206ENST00000602743 576 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
TOPBP1Q92547 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
TOPBP1Q92547 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TOPBP1Q92547 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TOPBP1Q92547 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
TOPBP1Q92547 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TOPBP1Q92547 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
TOPBP1Q92547 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
TOPBP1Q92547 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TOPBP1Q92547 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TOPBP1Q92547 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
TOPBP1Q92547 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
TOPBP1Q92547 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
TOPBP1Q92547 EIF3G-201ENST00000253108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TOPBP1Q92547 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TOPBP1Q92547 PEA15-203ENST00000368077 1021 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
TOPBP1Q92547 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC26.46■■□□□ 1.83
TOPBP1Q92547 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
TOPBP1Q92547 AL136361.1-201ENST00000435429 506 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
TOPBP1Q92547 AC010745.3-201ENST00000439745 415 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
TOPBP1Q92547 AC022217.1-201ENST00000521069 738 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
TOPBP1Q92547 AP003171.2-201ENST00000528208 925 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
TOPBP1Q92547 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
TOPBP1Q92547 AC005730.2-201ENST00000564549 1184 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
TOPBP1Q92547 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
TOPBP1Q92547 PRRC2B-210ENST00000638390 1084 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TOPBP1Q92547 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
TOPBP1Q92547 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TOPBP1Q92547 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
TOPBP1Q92547 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
TOPBP1Q92547 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TOPBP1Q92547 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
TOPBP1Q92547 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
TOPBP1Q92547 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
TOPBP1Q92547 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
TOPBP1Q92547 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TOPBP1Q92547 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.83
TOPBP1Q92547 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
TOPBP1Q92547 FAM24B-202ENST00000368898 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
TOPBP1Q92547 SMS-201ENST00000379404 1174 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.83
TOPBP1Q92547 AP000320.1-201ENST00000440403 471 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.83
TOPBP1Q92547 AL139246.4-201ENST00000442305 514 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.83
TOPBP1Q92547 AC018680.1-202ENST00000500324 525 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.8 ms