Protein–RNA interactions for Protein: Q5SW96

LDLRAP1, Low density lipoprotein receptor adapter protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LDLRAP1Q5SW96 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LDLRAP1Q5SW96 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LDLRAP1Q5SW96 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LDLRAP1Q5SW96 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LDLRAP1Q5SW96 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LDLRAP1Q5SW96 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LDLRAP1Q5SW96 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LDLRAP1Q5SW96 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LDLRAP1Q5SW96 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
LDLRAP1Q5SW96 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LDLRAP1Q5SW96 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LDLRAP1Q5SW96 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LDLRAP1Q5SW96 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LDLRAP1Q5SW96 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
LDLRAP1Q5SW96 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LDLRAP1Q5SW96 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LDLRAP1Q5SW96 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
LDLRAP1Q5SW96 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LDLRAP1Q5SW96 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LDLRAP1Q5SW96 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LDLRAP1Q5SW96 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LDLRAP1Q5SW96 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
LDLRAP1Q5SW96 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LDLRAP1Q5SW96 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LDLRAP1Q5SW96 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LDLRAP1Q5SW96 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LDLRAP1Q5SW96 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LDLRAP1Q5SW96 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LDLRAP1Q5SW96 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LDLRAP1Q5SW96 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LDLRAP1Q5SW96 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LDLRAP1Q5SW96 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LDLRAP1Q5SW96 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LDLRAP1Q5SW96 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LDLRAP1Q5SW96 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LDLRAP1Q5SW96 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LDLRAP1Q5SW96 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LDLRAP1Q5SW96 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LDLRAP1Q5SW96 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LDLRAP1Q5SW96 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LDLRAP1Q5SW96 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LDLRAP1Q5SW96 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LDLRAP1Q5SW96 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LDLRAP1Q5SW96 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LDLRAP1Q5SW96 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LDLRAP1Q5SW96 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LDLRAP1Q5SW96 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LDLRAP1Q5SW96 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LDLRAP1Q5SW96 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LDLRAP1Q5SW96 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LDLRAP1Q5SW96 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LDLRAP1Q5SW96 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LDLRAP1Q5SW96 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LDLRAP1Q5SW96 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
LDLRAP1Q5SW96 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LDLRAP1Q5SW96 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LDLRAP1Q5SW96 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LDLRAP1Q5SW96 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LDLRAP1Q5SW96 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
LDLRAP1Q5SW96 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LDLRAP1Q5SW96 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LDLRAP1Q5SW96 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LDLRAP1Q5SW96 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
LDLRAP1Q5SW96 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LDLRAP1Q5SW96 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LDLRAP1Q5SW96 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LDLRAP1Q5SW96 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LDLRAP1Q5SW96 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LDLRAP1Q5SW96 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LDLRAP1Q5SW96 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LDLRAP1Q5SW96 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LDLRAP1Q5SW96 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LDLRAP1Q5SW96 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LDLRAP1Q5SW96 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LDLRAP1Q5SW96 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LDLRAP1Q5SW96 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LDLRAP1Q5SW96 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LDLRAP1Q5SW96 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LDLRAP1Q5SW96 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LDLRAP1Q5SW96 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LDLRAP1Q5SW96 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LDLRAP1Q5SW96 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LDLRAP1Q5SW96 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LDLRAP1Q5SW96 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LDLRAP1Q5SW96 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LDLRAP1Q5SW96 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LDLRAP1Q5SW96 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LDLRAP1Q5SW96 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LDLRAP1Q5SW96 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
LDLRAP1Q5SW96 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LDLRAP1Q5SW96 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LDLRAP1Q5SW96 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LDLRAP1Q5SW96 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LDLRAP1Q5SW96 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LDLRAP1Q5SW96 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LDLRAP1Q5SW96 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LDLRAP1Q5SW96 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LDLRAP1Q5SW96 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LDLRAP1Q5SW96 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
LDLRAP1Q5SW96 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.4 ms