Protein–RNA interactions for Protein: Q53HL2

CDCA8, Borealin, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDCA8Q53HL2 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CDCA8Q53HL2 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CDCA8Q53HL2 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CDCA8Q53HL2 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CDCA8Q53HL2 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CDCA8Q53HL2 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CDCA8Q53HL2 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CDCA8Q53HL2 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CDCA8Q53HL2 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CDCA8Q53HL2 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CDCA8Q53HL2 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CDCA8Q53HL2 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CDCA8Q53HL2 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CDCA8Q53HL2 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CDCA8Q53HL2 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CDCA8Q53HL2 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CDCA8Q53HL2 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDCA8Q53HL2 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDCA8Q53HL2 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDCA8Q53HL2 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDCA8Q53HL2 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDCA8Q53HL2 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDCA8Q53HL2 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDCA8Q53HL2 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDCA8Q53HL2 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDCA8Q53HL2 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDCA8Q53HL2 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDCA8Q53HL2 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDCA8Q53HL2 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CDCA8Q53HL2 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDCA8Q53HL2 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDCA8Q53HL2 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CDCA8Q53HL2 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDCA8Q53HL2 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDCA8Q53HL2 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDCA8Q53HL2 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDCA8Q53HL2 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDCA8Q53HL2 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDCA8Q53HL2 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDCA8Q53HL2 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDCA8Q53HL2 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC22.2■■□□□ 1.15
CDCA8Q53HL2 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
CDCA8Q53HL2 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
CDCA8Q53HL2 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CDCA8Q53HL2 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CDCA8Q53HL2 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CDCA8Q53HL2 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CDCA8Q53HL2 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CDCA8Q53HL2 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CDCA8Q53HL2 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CDCA8Q53HL2 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CDCA8Q53HL2 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CDCA8Q53HL2 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CDCA8Q53HL2 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CDCA8Q53HL2 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CDCA8Q53HL2 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CDCA8Q53HL2 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CDCA8Q53HL2 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CDCA8Q53HL2 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CDCA8Q53HL2 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CDCA8Q53HL2 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CDCA8Q53HL2 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CDCA8Q53HL2 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CDCA8Q53HL2 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CDCA8Q53HL2 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CDCA8Q53HL2 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDCA8Q53HL2 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDCA8Q53HL2 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDCA8Q53HL2 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDCA8Q53HL2 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDCA8Q53HL2 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDCA8Q53HL2 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDCA8Q53HL2 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDCA8Q53HL2 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDCA8Q53HL2 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDCA8Q53HL2 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDCA8Q53HL2 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDCA8Q53HL2 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDCA8Q53HL2 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDCA8Q53HL2 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDCA8Q53HL2 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDCA8Q53HL2 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDCA8Q53HL2 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDCA8Q53HL2 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDCA8Q53HL2 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDCA8Q53HL2 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CDCA8Q53HL2 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDCA8Q53HL2 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDCA8Q53HL2 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDCA8Q53HL2 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDCA8Q53HL2 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDCA8Q53HL2 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDCA8Q53HL2 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDCA8Q53HL2 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDCA8Q53HL2 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDCA8Q53HL2 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDCA8Q53HL2 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDCA8Q53HL2 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDCA8Q53HL2 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDCA8Q53HL2 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms