Protein–RNA interactions for Protein: Q53GQ0

HSD17B12, Very-long-chain 3-oxoacyl-CoA reductase, humanhuman

Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSD17B12Q53GQ0 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
HSD17B12Q53GQ0 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
HSD17B12Q53GQ0 PPL-201ENST00000345988 6238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
HSD17B12Q53GQ0 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
HSD17B12Q53GQ0 RPTOR-201ENST00000306801 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
HSD17B12Q53GQ0 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
HSD17B12Q53GQ0 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC14.36□□□□□ -0.11
HSD17B12Q53GQ0 SEPT7-201ENST00000350320 4350 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
HSD17B12Q53GQ0 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
HSD17B12Q53GQ0 SPTLC2-201ENST00000216484 8170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
HSD17B12Q53GQ0 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
HSD17B12Q53GQ0 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
HSD17B12Q53GQ0 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
HSD17B12Q53GQ0 CLEC16A-203ENST00000409790 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
HSD17B12Q53GQ0 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
HSD17B12Q53GQ0 TBC1D2-201ENST00000342112 3046 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
HSD17B12Q53GQ0 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
HSD17B12Q53GQ0 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
HSD17B12Q53GQ0 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC14.36□□□□□ -0.11
HSD17B12Q53GQ0 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
HSD17B12Q53GQ0 DMTN-201ENST00000265800 2554 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
HSD17B12Q53GQ0 DMTN-207ENST00000517305 2551 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
HSD17B12Q53GQ0 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
HSD17B12Q53GQ0 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
HSD17B12Q53GQ0 TNFRSF11A-202ENST00000586569 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
HSD17B12Q53GQ0 TSPAN14-210ENST00000616406 2436 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
HSD17B12Q53GQ0 AC239800.3-201ENST00000424684 5243 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
HSD17B12Q53GQ0 TMEM200C-202ENST00000581347 10638 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
HSD17B12Q53GQ0 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
HSD17B12Q53GQ0 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
HSD17B12Q53GQ0 HBP1-201ENST00000222574 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
HSD17B12Q53GQ0 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
HSD17B12Q53GQ0 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
HSD17B12Q53GQ0 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
HSD17B12Q53GQ0 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
HSD17B12Q53GQ0 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
HSD17B12Q53GQ0 PCK2-203ENST00000545054 2505 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
HSD17B12Q53GQ0 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
HSD17B12Q53GQ0 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
HSD17B12Q53GQ0 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
HSD17B12Q53GQ0 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
HSD17B12Q53GQ0 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
HSD17B12Q53GQ0 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
HSD17B12Q53GQ0 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
HSD17B12Q53GQ0 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
HSD17B12Q53GQ0 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
HSD17B12Q53GQ0 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
HSD17B12Q53GQ0 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
HSD17B12Q53GQ0 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
HSD17B12Q53GQ0 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
HSD17B12Q53GQ0 IGFBP5-201ENST00000233813 6215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
HSD17B12Q53GQ0 TTC28-AS1-207ENST00000428584 5859 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
HSD17B12Q53GQ0 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
HSD17B12Q53GQ0 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
HSD17B12Q53GQ0 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
HSD17B12Q53GQ0 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
HSD17B12Q53GQ0 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
HSD17B12Q53GQ0 PTPN9-206ENST00000618819 7813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
HSD17B12Q53GQ0 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
HSD17B12Q53GQ0 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
HSD17B12Q53GQ0 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
HSD17B12Q53GQ0 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
HSD17B12Q53GQ0 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
HSD17B12Q53GQ0 MBOAT2-201ENST00000305997 7751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
HSD17B12Q53GQ0 GLUL-202ENST00000331872 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
HSD17B12Q53GQ0 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
HSD17B12Q53GQ0 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
HSD17B12Q53GQ0 MBD1-212ENST00000585672 2532 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
HSD17B12Q53GQ0 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
HSD17B12Q53GQ0 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
HSD17B12Q53GQ0 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
HSD17B12Q53GQ0 CHFR-204ENST00000443047 2990 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
HSD17B12Q53GQ0 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
HSD17B12Q53GQ0 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
HSD17B12Q53GQ0 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
HSD17B12Q53GQ0 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
HSD17B12Q53GQ0 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
HSD17B12Q53GQ0 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
HSD17B12Q53GQ0 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
HSD17B12Q53GQ0 CHD4-201ENST00000357008 6496 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
HSD17B12Q53GQ0 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
HSD17B12Q53GQ0 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
HSD17B12Q53GQ0 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
HSD17B12Q53GQ0 FAM219A-204ENST00000379081 3543 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
HSD17B12Q53GQ0 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
HSD17B12Q53GQ0 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
HSD17B12Q53GQ0 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
HSD17B12Q53GQ0 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
HSD17B12Q53GQ0 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
HSD17B12Q53GQ0 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC14.34□□□□□ -0.11
HSD17B12Q53GQ0 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
HSD17B12Q53GQ0 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
HSD17B12Q53GQ0 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
HSD17B12Q53GQ0 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
HSD17B12Q53GQ0 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
HSD17B12Q53GQ0 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
HSD17B12Q53GQ0 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
HSD17B12Q53GQ0 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
HSD17B12Q53GQ0 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
HSD17B12Q53GQ0 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 136.1 ms