Protein–RNA interactions for Protein: Q53GG5

PDLIM3, PDZ and LIM domain protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 364 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDLIM3Q53GG5 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
PDLIM3Q53GG5 ATP11B-201ENST00000323116 7325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PDLIM3Q53GG5 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PDLIM3Q53GG5 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PDLIM3Q53GG5 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PDLIM3Q53GG5 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PDLIM3Q53GG5 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PDLIM3Q53GG5 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PDLIM3Q53GG5 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PDLIM3Q53GG5 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
PDLIM3Q53GG5 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PDLIM3Q53GG5 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PDLIM3Q53GG5 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
PDLIM3Q53GG5 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PDLIM3Q53GG5 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PDLIM3Q53GG5 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PDLIM3Q53GG5 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PDLIM3Q53GG5 MIR6752-201ENST00000618442 71 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
PDLIM3Q53GG5 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
PDLIM3Q53GG5 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PDLIM3Q53GG5 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PDLIM3Q53GG5 SNX19-201ENST00000265909 6535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PDLIM3Q53GG5 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PDLIM3Q53GG5 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PDLIM3Q53GG5 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PDLIM3Q53GG5 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PDLIM3Q53GG5 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PDLIM3Q53GG5 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PDLIM3Q53GG5 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PDLIM3Q53GG5 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PDLIM3Q53GG5 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PDLIM3Q53GG5 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PDLIM3Q53GG5 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PDLIM3Q53GG5 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PDLIM3Q53GG5 SEMA5B-206ENST00000451055 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PDLIM3Q53GG5 MARC1-201ENST00000366910 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PDLIM3Q53GG5 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PDLIM3Q53GG5 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PDLIM3Q53GG5 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PDLIM3Q53GG5 OSBPL3-201ENST00000313367 6760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PDLIM3Q53GG5 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PDLIM3Q53GG5 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
PDLIM3Q53GG5 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
PDLIM3Q53GG5 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
PDLIM3Q53GG5 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
PDLIM3Q53GG5 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
PDLIM3Q53GG5 RABEPK-206ENST00000628863 1537 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
PDLIM3Q53GG5 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PDLIM3Q53GG5 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PDLIM3Q53GG5 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
PDLIM3Q53GG5 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PDLIM3Q53GG5 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PDLIM3Q53GG5 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PDLIM3Q53GG5 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
PDLIM3Q53GG5 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
PDLIM3Q53GG5 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
PDLIM3Q53GG5 GTPBP1-201ENST00000216044 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PDLIM3Q53GG5 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
PDLIM3Q53GG5 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
PDLIM3Q53GG5 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
PDLIM3Q53GG5 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PDLIM3Q53GG5 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
PDLIM3Q53GG5 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
PDLIM3Q53GG5 AC138969.2-201ENST00000532739 9932 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
PDLIM3Q53GG5 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PDLIM3Q53GG5 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PDLIM3Q53GG5 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
PDLIM3Q53GG5 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PDLIM3Q53GG5 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
PDLIM3Q53GG5 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
PDLIM3Q53GG5 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PDLIM3Q53GG5 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
PDLIM3Q53GG5 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
PDLIM3Q53GG5 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
PDLIM3Q53GG5 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
PDLIM3Q53GG5 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
PDLIM3Q53GG5 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PDLIM3Q53GG5 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
PDLIM3Q53GG5 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
PDLIM3Q53GG5 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
PDLIM3Q53GG5 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
PDLIM3Q53GG5 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
PDLIM3Q53GG5 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
PDLIM3Q53GG5 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
PDLIM3Q53GG5 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
PDLIM3Q53GG5 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PDLIM3Q53GG5 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PDLIM3Q53GG5 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PDLIM3Q53GG5 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
PDLIM3Q53GG5 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PDLIM3Q53GG5 TMEM63C-201ENST00000298351 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PDLIM3Q53GG5 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PDLIM3Q53GG5 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
PDLIM3Q53GG5 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PDLIM3Q53GG5 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PDLIM3Q53GG5 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
PDLIM3Q53GG5 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PDLIM3Q53GG5 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
PDLIM3Q53GG5 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PDLIM3Q53GG5 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
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