Protein–RNA interactions for Protein: Q2M1V0

ISX, Intestine-specific homeobox, humanhuman

Predictions only

Length 245 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ISXQ2M1V0 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ISXQ2M1V0 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ISXQ2M1V0 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ISXQ2M1V0 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ISXQ2M1V0 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ISXQ2M1V0 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ISXQ2M1V0 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ISXQ2M1V0 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ISXQ2M1V0 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ISXQ2M1V0 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ISXQ2M1V0 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ISXQ2M1V0 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ISXQ2M1V0 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ISXQ2M1V0 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ISXQ2M1V0 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ISXQ2M1V0 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ISXQ2M1V0 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ISXQ2M1V0 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ISXQ2M1V0 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ISXQ2M1V0 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ISXQ2M1V0 LGALS2-201ENST00000215886 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ISXQ2M1V0 BLVRB-201ENST00000263368 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ISXQ2M1V0 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ISXQ2M1V0 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ISXQ2M1V0 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ISXQ2M1V0 ECSIT-203ENST00000417981 970 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ISXQ2M1V0 KRT223P-202ENST00000449164 1292 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ISXQ2M1V0 ROPN1-207ENST00000484329 566 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ISXQ2M1V0 RNF216P1-213ENST00000494947 946 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ISXQ2M1V0 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ISXQ2M1V0 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ISXQ2M1V0 CACNA2D4-208ENST00000538027 952 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ISXQ2M1V0 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ISXQ2M1V0 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ISXQ2M1V0 FAM171B-202ENST00000612606 940 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ISXQ2M1V0 AC133552.6-201ENST00000613406 534 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ISXQ2M1V0 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ISXQ2M1V0 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ISXQ2M1V0 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ISXQ2M1V0 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ISXQ2M1V0 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ISXQ2M1V0 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ISXQ2M1V0 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ISXQ2M1V0 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ISXQ2M1V0 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ISXQ2M1V0 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ISXQ2M1V0 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ISXQ2M1V0 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ISXQ2M1V0 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ISXQ2M1V0 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ISXQ2M1V0 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ISXQ2M1V0 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ISXQ2M1V0 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ISXQ2M1V0 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ISXQ2M1V0 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ISXQ2M1V0 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ISXQ2M1V0 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ISXQ2M1V0 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ISXQ2M1V0 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ISXQ2M1V0 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ISXQ2M1V0 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ISXQ2M1V0 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ISXQ2M1V0 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ISXQ2M1V0 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
ISXQ2M1V0 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ISXQ2M1V0 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ISXQ2M1V0 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ISXQ2M1V0 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ISXQ2M1V0 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
ISXQ2M1V0 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ISXQ2M1V0 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ISXQ2M1V0 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ISXQ2M1V0 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ISXQ2M1V0 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ISXQ2M1V0 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ISXQ2M1V0 Z94721.1-201ENST00000444102 385 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ISXQ2M1V0 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ISXQ2M1V0 OMP-201ENST00000529803 492 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ISXQ2M1V0 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ISXQ2M1V0 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ISXQ2M1V0 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ISXQ2M1V0 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
ISXQ2M1V0 MIR6775-201ENST00000617557 69 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
ISXQ2M1V0 AL033527.4-201ENST00000641026 673 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
ISXQ2M1V0 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ISXQ2M1V0 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
ISXQ2M1V0 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ISXQ2M1V0 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ISXQ2M1V0 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ISXQ2M1V0 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ISXQ2M1V0 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ISXQ2M1V0 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ISXQ2M1V0 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ISXQ2M1V0 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ISXQ2M1V0 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ISXQ2M1V0 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ISXQ2M1V0 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ISXQ2M1V0 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ISXQ2M1V0 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ISXQ2M1V0 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms