Protein–RNA interactions for Protein: Q15836

VAMP3, Vesicle-associated membrane protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP3Q15836 MAPK4-206ENST00000592595 4330 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
VAMP3Q15836 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
VAMP3Q15836 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
VAMP3Q15836 CAMSAP3-201ENST00000160298 3889 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
VAMP3Q15836 FAM193A-201ENST00000324666 4846 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
VAMP3Q15836 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
VAMP3Q15836 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
VAMP3Q15836 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
VAMP3Q15836 CACNA1G-218ENST00000507510 7014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
VAMP3Q15836 ADD2-202ENST00000355733 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
VAMP3Q15836 ACTR2-202ENST00000377982 2685 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
VAMP3Q15836 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
VAMP3Q15836 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
VAMP3Q15836 GIPC3-201ENST00000322315 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
VAMP3Q15836 GRAMD4-201ENST00000361034 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
VAMP3Q15836 DCST2-202ENST00000368424 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
VAMP3Q15836 LOXL3-202ENST00000393937 2398 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
VAMP3Q15836 STIM1-201ENST00000300737 4038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
VAMP3Q15836 B3GNT5-202ENST00000460419 3368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
VAMP3Q15836 NHSL1-204ENST00000427025 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
VAMP3Q15836 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
VAMP3Q15836 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
VAMP3Q15836 SAMD15-201ENST00000216471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
VAMP3Q15836 FOSB-212ENST00000592811 3089 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
VAMP3Q15836 PBX3-203ENST00000373487 2902 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
VAMP3Q15836 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
VAMP3Q15836 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
VAMP3Q15836 TGM1-201ENST00000206765 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
VAMP3Q15836 FAAP100-201ENST00000327787 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
VAMP3Q15836 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
VAMP3Q15836 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
VAMP3Q15836 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC11.55□□□□□ -0.56
VAMP3Q15836 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
VAMP3Q15836 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
VAMP3Q15836 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
VAMP3Q15836 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
VAMP3Q15836 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
VAMP3Q15836 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
VAMP3Q15836 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
VAMP3Q15836 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
VAMP3Q15836 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
VAMP3Q15836 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
VAMP3Q15836 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
VAMP3Q15836 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
VAMP3Q15836 RIPOR1-204ENST00000428437 4152 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
VAMP3Q15836 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
VAMP3Q15836 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
VAMP3Q15836 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
VAMP3Q15836 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
VAMP3Q15836 FBXL4-201ENST00000229971 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
VAMP3Q15836 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
VAMP3Q15836 RAD17-207ENST00000361732 3002 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
VAMP3Q15836 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
VAMP3Q15836 AC068075.1-201ENST00000519714 1832 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
VAMP3Q15836 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
VAMP3Q15836 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
VAMP3Q15836 AGPAT3-218ENST00000546158 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
VAMP3Q15836 C9orf47-203ENST00000375851 4837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
VAMP3Q15836 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
VAMP3Q15836 DNAJB12-201ENST00000338820 4360 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
VAMP3Q15836 DMBT1-201ENST00000330163 5802 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
VAMP3Q15836 DMBT1-206ENST00000368956 5802 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
VAMP3Q15836 CPSF7-201ENST00000340437 3695 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
VAMP3Q15836 HNRNPH1-202ENST00000356731 3667 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
VAMP3Q15836 AAR2-201ENST00000320849 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
VAMP3Q15836 SHANK2-218ENST00000601538 9062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
VAMP3Q15836 C19orf12-209ENST00000623113 4242 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
VAMP3Q15836 STRIP2-201ENST00000249344 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
VAMP3Q15836 SAR1A-204ENST00000373241 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
VAMP3Q15836 AL359881.3-201ENST00000602640 1721 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
VAMP3Q15836 HSPA12A-201ENST00000369209 5722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
VAMP3Q15836 DLGAP3-201ENST00000235180 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
VAMP3Q15836 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
VAMP3Q15836 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
VAMP3Q15836 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
VAMP3Q15836 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
VAMP3Q15836 MUTYH-210ENST00000450313 1929 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
VAMP3Q15836 SFSWAP-201ENST00000261674 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
VAMP3Q15836 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
VAMP3Q15836 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
VAMP3Q15836 ZNF236-202ENST00000320610 7124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
VAMP3Q15836 GNAS-215ENST00000371102 3438 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
VAMP3Q15836 CES3-201ENST00000303334 3834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
VAMP3Q15836 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
VAMP3Q15836 INHBA-201ENST00000242208 6064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
VAMP3Q15836 JMJD6-208ENST00000617192 5517 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
VAMP3Q15836 NEDD4L-208ENST00000456173 4978 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
VAMP3Q15836 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
VAMP3Q15836 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
VAMP3Q15836 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
VAMP3Q15836 ADAM33-206ENST00000617732 1971 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
VAMP3Q15836 ALK-205ENST00000618119 4646 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
VAMP3Q15836 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
VAMP3Q15836 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
VAMP3Q15836 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
VAMP3Q15836 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
VAMP3Q15836 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
VAMP3Q15836 NFKBIZ-202ENST00000326172 3923 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
VAMP3Q15836 YTHDC1-201ENST00000344157 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
VAMP3Q15836 SEC23A-201ENST00000307712 4135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
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