Protein–RNA interactions for Protein: Q14964

RAB39A, Ras-related protein Rab-39A, humanhuman

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Length 217 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB39AQ14964 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
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RAB39AQ14964 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAB39AQ14964 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAB39AQ14964 PCDHGB1-202ENST00000611598 2592 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAB39AQ14964 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAB39AQ14964 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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RAB39AQ14964 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
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RAB39AQ14964 CDKN2AIP-201ENST00000302350 2646 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RAB39AQ14964 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RAB39AQ14964 AC007191.1-201ENST00000623179 2995 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
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RAB39AQ14964 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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RAB39AQ14964 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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RAB39AQ14964 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RAB39AQ14964 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RAB39AQ14964 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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RAB39AQ14964 SLC11A2-204ENST00000541174 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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RAB39AQ14964 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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RAB39AQ14964 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RAB39AQ14964 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RAB39AQ14964 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
RAB39AQ14964 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RAB39AQ14964 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RAB39AQ14964 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RAB39AQ14964 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RAB39AQ14964 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RAB39AQ14964 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RAB39AQ14964 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
RAB39AQ14964 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RAB39AQ14964 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RAB39AQ14964 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
RAB39AQ14964 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
RAB39AQ14964 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
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