Protein–RNA interactions for Protein: Q12980

NPRL3, GATOR complex protein NPRL3, humanhuman

Predictions only

Length 569 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPRL3Q12980 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC15.07■□□□□ 0
NPRL3Q12980 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NPRL3Q12980 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NPRL3Q12980 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NPRL3Q12980 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
NPRL3Q12980 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NPRL3Q12980 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NPRL3Q12980 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
NPRL3Q12980 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NPRL3Q12980 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NPRL3Q12980 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
NPRL3Q12980 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NPRL3Q12980 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NPRL3Q12980 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
NPRL3Q12980 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NPRL3Q12980 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NPRL3Q12980 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NPRL3Q12980 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
NPRL3Q12980 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC15.06■□□□□ 0
NPRL3Q12980 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
NPRL3Q12980 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NPRL3Q12980 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
NPRL3Q12980 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NPRL3Q12980 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NPRL3Q12980 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NPRL3Q12980 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NPRL3Q12980 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NPRL3Q12980 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NPRL3Q12980 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
NPRL3Q12980 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NPRL3Q12980 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NPRL3Q12980 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NPRL3Q12980 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
NPRL3Q12980 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
NPRL3Q12980 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
NPRL3Q12980 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
NPRL3Q12980 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
NPRL3Q12980 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
NPRL3Q12980 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NPRL3Q12980 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC15.06■□□□□ 0
NPRL3Q12980 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC15.06■□□□□ 0
NPRL3Q12980 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
NPRL3Q12980 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
NPRL3Q12980 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC15.06■□□□□ 0
NPRL3Q12980 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
NPRL3Q12980 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NPRL3Q12980 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
NPRL3Q12980 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NPRL3Q12980 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NPRL3Q12980 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
NPRL3Q12980 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
NPRL3Q12980 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
NPRL3Q12980 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
NPRL3Q12980 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NPRL3Q12980 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
NPRL3Q12980 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
NPRL3Q12980 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC15.06■□□□□ 0
NPRL3Q12980 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.06■□□□□ 0
NPRL3Q12980 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NPRL3Q12980 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NPRL3Q12980 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NPRL3Q12980 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NPRL3Q12980 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
NPRL3Q12980 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
NPRL3Q12980 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
NPRL3Q12980 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
NPRL3Q12980 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
NPRL3Q12980 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
NPRL3Q12980 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
NPRL3Q12980 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
NPRL3Q12980 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
NPRL3Q12980 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NPRL3Q12980 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NPRL3Q12980 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
NPRL3Q12980 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NPRL3Q12980 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
NPRL3Q12980 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
NPRL3Q12980 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
NPRL3Q12980 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
NPRL3Q12980 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NPRL3Q12980 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
NPRL3Q12980 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
NPRL3Q12980 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
NPRL3Q12980 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
NPRL3Q12980 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
NPRL3Q12980 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
NPRL3Q12980 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
NPRL3Q12980 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
NPRL3Q12980 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
NPRL3Q12980 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC15.05■□□□□ -0
NPRL3Q12980 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NPRL3Q12980 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
NPRL3Q12980 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
NPRL3Q12980 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
NPRL3Q12980 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
NPRL3Q12980 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NPRL3Q12980 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC15.05■□□□□ -0
NPRL3Q12980 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NPRL3Q12980 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
NPRL3Q12980 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms